Protein–RNA interactions for Protein: P61807

Snn, Stannin, mousemouse

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Length 88 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnnP61807 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,43■■□□□ 1,5
SnnP61807 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,43■■□□□ 1,5
SnnP61807 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24,43■■□□□ 1,5
SnnP61807 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,41■■□□□ 1,5
SnnP61807 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,4■■□□□ 1,5
SnnP61807 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,39■■□□□ 1,5
SnnP61807 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,38■■□□□ 1,49
SnnP61807 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,38■■□□□ 1,49
SnnP61807 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24,38■■□□□ 1,49
SnnP61807 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24,37■■□□□ 1,49
SnnP61807 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,37■■□□□ 1,49
SnnP61807 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,37■■□□□ 1,49
SnnP61807 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24,37■■□□□ 1,49
SnnP61807 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24,36■■□□□ 1,49
SnnP61807 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,36■■□□□ 1,49
SnnP61807 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,36■■□□□ 1,49
SnnP61807 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,35■■□□□ 1,49
SnnP61807 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,35■■□□□ 1,49
SnnP61807 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24,35■■□□□ 1,49
SnnP61807 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,35■■□□□ 1,49
SnnP61807 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24,33■■□□□ 1,48
SnnP61807 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,33■■□□□ 1,48
SnnP61807 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24,32■■□□□ 1,48
SnnP61807 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,32■■□□□ 1,48
SnnP61807 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,32■■□□□ 1,48
SnnP61807 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,32■■□□□ 1,48
SnnP61807 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24,32■■□□□ 1,48
SnnP61807 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24,31■■□□□ 1,48
SnnP61807 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,31■■□□□ 1,48
SnnP61807 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,3■■□□□ 1,48
SnnP61807 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24,29■■□□□ 1,48
SnnP61807 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,28■■□□□ 1,48
SnnP61807 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,28■■□□□ 1,48
SnnP61807 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24,28■■□□□ 1,48
SnnP61807 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,26■■□□□ 1,47
SnnP61807 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,26■■□□□ 1,47
SnnP61807 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,25■■□□□ 1,47
SnnP61807 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,24■■□□□ 1,47
SnnP61807 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,24■■□□□ 1,47
SnnP61807 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,23■■□□□ 1,47
SnnP61807 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,22■■□□□ 1,47
SnnP61807 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,22■■□□□ 1,47
SnnP61807 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24,22■■□□□ 1,47
SnnP61807 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24,21■■□□□ 1,47
SnnP61807 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,21■■□□□ 1,47
SnnP61807 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,21■■□□□ 1,47
SnnP61807 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24,21■■□□□ 1,47
SnnP61807 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,2■■□□□ 1,46
SnnP61807 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24,2■■□□□ 1,46
SnnP61807 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,19■■□□□ 1,46
SnnP61807 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24,19■■□□□ 1,46
SnnP61807 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24,19■■□□□ 1,46
SnnP61807 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24,18■■□□□ 1,46
SnnP61807 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,18■■□□□ 1,46
SnnP61807 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,17■■□□□ 1,46
SnnP61807 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,16■■□□□ 1,46
SnnP61807 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,16■■□□□ 1,46
SnnP61807 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,15■■□□□ 1,46
SnnP61807 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,15■■□□□ 1,46
SnnP61807 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24,15■■□□□ 1,46
SnnP61807 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,14■■□□□ 1,46
SnnP61807 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24,13■■□□□ 1,45
SnnP61807 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,13■■□□□ 1,45
SnnP61807 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24,12■■□□□ 1,45
SnnP61807 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24,1■■□□□ 1,45
SnnP61807 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,1■■□□□ 1,45
SnnP61807 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24,09■■□□□ 1,45
SnnP61807 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,09■■□□□ 1,45
SnnP61807 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,09■■□□□ 1,45
SnnP61807 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,08■■□□□ 1,45
SnnP61807 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,07■■□□□ 1,44
SnnP61807 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24,06■■□□□ 1,44
SnnP61807 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24,06■■□□□ 1,44
SnnP61807 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,05■■□□□ 1,44
SnnP61807 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24,05■■□□□ 1,44
SnnP61807 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,05■■□□□ 1,44
SnnP61807 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,05■■□□□ 1,44
SnnP61807 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24,04■■□□□ 1,44
SnnP61807 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,04■■□□□ 1,44
SnnP61807 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,03■■□□□ 1,44
SnnP61807 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24,03■■□□□ 1,44
SnnP61807 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24,03■■□□□ 1,44
SnnP61807 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24,03■■□□□ 1,44
SnnP61807 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,03■■□□□ 1,44
SnnP61807 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,02■■□□□ 1,44
SnnP61807 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,02■■□□□ 1,44
SnnP61807 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,01■■□□□ 1,43
SnnP61807 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24,01■■□□□ 1,43
SnnP61807 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,01■■□□□ 1,43
SnnP61807 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1,43
SnnP61807 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1,43
SnnP61807 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1,43
SnnP61807 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23,99■■□□□ 1,43
SnnP61807 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23,99■■□□□ 1,43
SnnP61807 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,97■■□□□ 1,43
SnnP61807 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23,97■■□□□ 1,43
SnnP61807 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23,95■■□□□ 1,43
SnnP61807 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23,95■■□□□ 1,42
SnnP61807 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23,95■■□□□ 1,42
SnnP61807 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23,95■■□□□ 1,42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,8 ms