Protein–RNA interactions for Protein: P61407

Tdrd6, Tudor domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 2,134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd6P61407 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tdrd6P61407 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tdrd6P61407 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tdrd6P61407 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tdrd6P61407 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tdrd6P61407 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tdrd6P61407 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Tdrd6P61407 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tdrd6P61407 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tdrd6P61407 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tdrd6P61407 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tdrd6P61407 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tdrd6P61407 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tdrd6P61407 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tdrd6P61407 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tdrd6P61407 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tdrd6P61407 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tdrd6P61407 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tdrd6P61407 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tdrd6P61407 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tdrd6P61407 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tdrd6P61407 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tdrd6P61407 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tdrd6P61407 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tdrd6P61407 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tdrd6P61407 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tdrd6P61407 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tdrd6P61407 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Tdrd6P61407 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Tdrd6P61407 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Tdrd6P61407 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tdrd6P61407 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tdrd6P61407 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tdrd6P61407 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tdrd6P61407 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tdrd6P61407 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tdrd6P61407 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tdrd6P61407 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tdrd6P61407 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tdrd6P61407 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tdrd6P61407 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tdrd6P61407 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tdrd6P61407 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Tdrd6P61407 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tdrd6P61407 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tdrd6P61407 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tdrd6P61407 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tdrd6P61407 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tdrd6P61407 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Tdrd6P61407 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Tdrd6P61407 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Tdrd6P61407 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tdrd6P61407 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tdrd6P61407 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tdrd6P61407 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tdrd6P61407 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tdrd6P61407 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tdrd6P61407 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tdrd6P61407 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Tdrd6P61407 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tdrd6P61407 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tdrd6P61407 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tdrd6P61407 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Tdrd6P61407 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tdrd6P61407 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tdrd6P61407 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tdrd6P61407 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tdrd6P61407 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tdrd6P61407 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tdrd6P61407 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Tdrd6P61407 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tdrd6P61407 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tdrd6P61407 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tdrd6P61407 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tdrd6P61407 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tdrd6P61407 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tdrd6P61407 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tdrd6P61407 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tdrd6P61407 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tdrd6P61407 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tdrd6P61407 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tdrd6P61407 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tdrd6P61407 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Tdrd6P61407 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tdrd6P61407 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tdrd6P61407 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tdrd6P61407 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tdrd6P61407 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tdrd6P61407 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Tdrd6P61407 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tdrd6P61407 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tdrd6P61407 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tdrd6P61407 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tdrd6P61407 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tdrd6P61407 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tdrd6P61407 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tdrd6P61407 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tdrd6P61407 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tdrd6P61407 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tdrd6P61407 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119.5 ms