Protein–RNA interactions for Protein: P61166

Tmem258, Transmembrane protein 258, mousemouse

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem258P61166 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem258P61166 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem258P61166 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem258P61166 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem258P61166 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem258P61166 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem258P61166 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem258P61166 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem258P61166 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem258P61166 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem258P61166 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem258P61166 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem258P61166 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem258P61166 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem258P61166 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmem258P61166 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem258P61166 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmem258P61166 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem258P61166 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem258P61166 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem258P61166 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem258P61166 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem258P61166 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmem258P61166 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem258P61166 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem258P61166 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem258P61166 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem258P61166 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem258P61166 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem258P61166 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem258P61166 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem258P61166 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem258P61166 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem258P61166 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem258P61166 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem258P61166 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem258P61166 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem258P61166 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem258P61166 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem258P61166 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem258P61166 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem258P61166 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem258P61166 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem258P61166 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem258P61166 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem258P61166 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem258P61166 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem258P61166 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem258P61166 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem258P61166 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tmem258P61166 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem258P61166 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem258P61166 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem258P61166 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem258P61166 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem258P61166 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem258P61166 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem258P61166 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem258P61166 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem258P61166 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmem258P61166 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem258P61166 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem258P61166 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem258P61166 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem258P61166 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem258P61166 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem258P61166 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem258P61166 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem258P61166 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem258P61166 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem258P61166 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem258P61166 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem258P61166 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem258P61166 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem258P61166 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem258P61166 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem258P61166 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem258P61166 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem258P61166 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem258P61166 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmem258P61166 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem258P61166 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem258P61166 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem258P61166 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem258P61166 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem258P61166 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem258P61166 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem258P61166 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem258P61166 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem258P61166 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem258P61166 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem258P61166 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem258P61166 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem258P61166 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem258P61166 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem258P61166 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem258P61166 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem258P61166 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem258P61166 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem258P61166 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.5 ms