Protein–RNA interactions for Protein: P60334

Cdo1, Cysteine dioxygenase type 1, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdo1P60334 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cdo1P60334 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cdo1P60334 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cdo1P60334 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cdo1P60334 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cdo1P60334 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Cdo1P60334 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Cdo1P60334 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cdo1P60334 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cdo1P60334 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cdo1P60334 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cdo1P60334 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cdo1P60334 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cdo1P60334 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cdo1P60334 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cdo1P60334 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cdo1P60334 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cdo1P60334 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cdo1P60334 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cdo1P60334 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cdo1P60334 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cdo1P60334 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Cdo1P60334 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cdo1P60334 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cdo1P60334 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cdo1P60334 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cdo1P60334 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cdo1P60334 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cdo1P60334 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cdo1P60334 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cdo1P60334 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cdo1P60334 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cdo1P60334 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cdo1P60334 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cdo1P60334 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cdo1P60334 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cdo1P60334 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cdo1P60334 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cdo1P60334 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cdo1P60334 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Cdo1P60334 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cdo1P60334 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cdo1P60334 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cdo1P60334 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cdo1P60334 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cdo1P60334 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cdo1P60334 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cdo1P60334 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cdo1P60334 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cdo1P60334 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cdo1P60334 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Cdo1P60334 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cdo1P60334 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Cdo1P60334 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cdo1P60334 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cdo1P60334 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cdo1P60334 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Cdo1P60334 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cdo1P60334 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cdo1P60334 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cdo1P60334 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cdo1P60334 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cdo1P60334 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cdo1P60334 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cdo1P60334 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cdo1P60334 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cdo1P60334 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cdo1P60334 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cdo1P60334 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cdo1P60334 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Cdo1P60334 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cdo1P60334 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Cdo1P60334 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cdo1P60334 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cdo1P60334 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cdo1P60334 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cdo1P60334 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cdo1P60334 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cdo1P60334 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cdo1P60334 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cdo1P60334 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cdo1P60334 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cdo1P60334 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cdo1P60334 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cdo1P60334 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cdo1P60334 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cdo1P60334 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cdo1P60334 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cdo1P60334 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cdo1P60334 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cdo1P60334 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cdo1P60334 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cdo1P60334 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cdo1P60334 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cdo1P60334 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Cdo1P60334 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cdo1P60334 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cdo1P60334 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cdo1P60334 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cdo1P60334 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms