Protein–RNA interactions for Protein: P59242

Cgn, Cingulin, mousemouse

Predictions only

Length 1,191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CgnP59242 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CgnP59242 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CgnP59242 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CgnP59242 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CgnP59242 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CgnP59242 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CgnP59242 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CgnP59242 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CgnP59242 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CgnP59242 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CgnP59242 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CgnP59242 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CgnP59242 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CgnP59242 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CgnP59242 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CgnP59242 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CgnP59242 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CgnP59242 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CgnP59242 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CgnP59242 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CgnP59242 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CgnP59242 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CgnP59242 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CgnP59242 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CgnP59242 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CgnP59242 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CgnP59242 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CgnP59242 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CgnP59242 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CgnP59242 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CgnP59242 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CgnP59242 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CgnP59242 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
CgnP59242 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CgnP59242 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CgnP59242 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CgnP59242 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CgnP59242 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CgnP59242 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CgnP59242 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CgnP59242 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CgnP59242 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CgnP59242 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CgnP59242 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CgnP59242 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CgnP59242 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CgnP59242 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CgnP59242 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CgnP59242 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CgnP59242 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CgnP59242 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CgnP59242 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CgnP59242 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CgnP59242 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CgnP59242 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CgnP59242 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CgnP59242 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CgnP59242 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CgnP59242 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CgnP59242 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CgnP59242 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CgnP59242 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CgnP59242 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CgnP59242 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28.51■■■□□ 2.16
CgnP59242 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CgnP59242 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CgnP59242 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CgnP59242 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CgnP59242 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CgnP59242 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CgnP59242 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CgnP59242 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CgnP59242 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CgnP59242 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CgnP59242 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CgnP59242 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CgnP59242 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CgnP59242 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CgnP59242 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CgnP59242 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CgnP59242 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CgnP59242 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CgnP59242 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CgnP59242 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CgnP59242 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CgnP59242 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CgnP59242 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
CgnP59242 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CgnP59242 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CgnP59242 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CgnP59242 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CgnP59242 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CgnP59242 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CgnP59242 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CgnP59242 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CgnP59242 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CgnP59242 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CgnP59242 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CgnP59242 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CgnP59242 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms