Protein–RNA interactions for Protein: P58501

Paxbp1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxbp1P58501 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Paxbp1P58501 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Paxbp1P58501 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
Paxbp1P58501 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Paxbp1P58501 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Paxbp1P58501 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Paxbp1P58501 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Paxbp1P58501 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Paxbp1P58501 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Paxbp1P58501 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Paxbp1P58501 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Paxbp1P58501 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
Paxbp1P58501 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Paxbp1P58501 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Paxbp1P58501 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Paxbp1P58501 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Paxbp1P58501 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Paxbp1P58501 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Paxbp1P58501 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Paxbp1P58501 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Paxbp1P58501 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Paxbp1P58501 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Paxbp1P58501 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Paxbp1P58501 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Paxbp1P58501 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Paxbp1P58501 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Paxbp1P58501 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Paxbp1P58501 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Paxbp1P58501 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Paxbp1P58501 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Paxbp1P58501 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Paxbp1P58501 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Paxbp1P58501 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Paxbp1P58501 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Paxbp1P58501 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Paxbp1P58501 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Paxbp1P58501 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Paxbp1P58501 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Paxbp1P58501 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Paxbp1P58501 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Paxbp1P58501 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Paxbp1P58501 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Paxbp1P58501 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Paxbp1P58501 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Paxbp1P58501 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Paxbp1P58501 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Paxbp1P58501 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Paxbp1P58501 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Paxbp1P58501 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Paxbp1P58501 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Paxbp1P58501 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Paxbp1P58501 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Paxbp1P58501 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Paxbp1P58501 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Paxbp1P58501 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Paxbp1P58501 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Paxbp1P58501 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Paxbp1P58501 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Paxbp1P58501 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Paxbp1P58501 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Paxbp1P58501 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Paxbp1P58501 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Paxbp1P58501 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Paxbp1P58501 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Paxbp1P58501 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Paxbp1P58501 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Paxbp1P58501 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Paxbp1P58501 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Paxbp1P58501 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Paxbp1P58501 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Paxbp1P58501 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Paxbp1P58501 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Paxbp1P58501 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Paxbp1P58501 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Paxbp1P58501 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Paxbp1P58501 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Paxbp1P58501 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Paxbp1P58501 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Paxbp1P58501 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Paxbp1P58501 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Paxbp1P58501 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Paxbp1P58501 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Paxbp1P58501 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Paxbp1P58501 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Paxbp1P58501 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Paxbp1P58501 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Paxbp1P58501 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Paxbp1P58501 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Paxbp1P58501 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Paxbp1P58501 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Paxbp1P58501 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Paxbp1P58501 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Paxbp1P58501 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Paxbp1P58501 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Paxbp1P58501 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Paxbp1P58501 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Paxbp1P58501 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Paxbp1P58501 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Paxbp1P58501 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Paxbp1P58501 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms