Protein–RNA interactions for Protein: P56394

Cox17, Cytochrome c oxidase copper chaperone, mousemouse

Predictions only

Length 63 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox17P56394 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cox17P56394 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cox17P56394 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cox17P56394 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cox17P56394 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cox17P56394 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cox17P56394 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cox17P56394 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cox17P56394 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cox17P56394 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cox17P56394 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cox17P56394 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cox17P56394 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cox17P56394 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cox17P56394 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Cox17P56394 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cox17P56394 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cox17P56394 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cox17P56394 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cox17P56394 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cox17P56394 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cox17P56394 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Cox17P56394 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cox17P56394 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Cox17P56394 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cox17P56394 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cox17P56394 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cox17P56394 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cox17P56394 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cox17P56394 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cox17P56394 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cox17P56394 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cox17P56394 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cox17P56394 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cox17P56394 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cox17P56394 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cox17P56394 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cox17P56394 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cox17P56394 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cox17P56394 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cox17P56394 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cox17P56394 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cox17P56394 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cox17P56394 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cox17P56394 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cox17P56394 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cox17P56394 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cox17P56394 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cox17P56394 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cox17P56394 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cox17P56394 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cox17P56394 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cox17P56394 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cox17P56394 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cox17P56394 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cox17P56394 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cox17P56394 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cox17P56394 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cox17P56394 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cox17P56394 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cox17P56394 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cox17P56394 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cox17P56394 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cox17P56394 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cox17P56394 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cox17P56394 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cox17P56394 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cox17P56394 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cox17P56394 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Cox17P56394 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cox17P56394 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cox17P56394 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cox17P56394 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cox17P56394 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cox17P56394 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cox17P56394 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cox17P56394 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cox17P56394 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cox17P56394 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cox17P56394 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cox17P56394 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cox17P56394 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cox17P56394 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cox17P56394 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cox17P56394 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cox17P56394 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cox17P56394 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cox17P56394 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cox17P56394 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cox17P56394 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Cox17P56394 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cox17P56394 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Cox17P56394 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cox17P56394 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Cox17P56394 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cox17P56394 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cox17P56394 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cox17P56394 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cox17P56394 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cox17P56394 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms