Protein–RNA interactions for Protein: P56389

Cda, Cytidine deaminase, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CdaP56389 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CdaP56389 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CdaP56389 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CdaP56389 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CdaP56389 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CdaP56389 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CdaP56389 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CdaP56389 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CdaP56389 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CdaP56389 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CdaP56389 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CdaP56389 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CdaP56389 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CdaP56389 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CdaP56389 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CdaP56389 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CdaP56389 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CdaP56389 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CdaP56389 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CdaP56389 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CdaP56389 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CdaP56389 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CdaP56389 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CdaP56389 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CdaP56389 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CdaP56389 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CdaP56389 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CdaP56389 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CdaP56389 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CdaP56389 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CdaP56389 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CdaP56389 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CdaP56389 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CdaP56389 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CdaP56389 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CdaP56389 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CdaP56389 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CdaP56389 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CdaP56389 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CdaP56389 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CdaP56389 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CdaP56389 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CdaP56389 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CdaP56389 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
CdaP56389 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CdaP56389 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CdaP56389 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CdaP56389 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CdaP56389 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CdaP56389 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CdaP56389 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CdaP56389 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CdaP56389 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CdaP56389 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CdaP56389 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CdaP56389 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CdaP56389 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CdaP56389 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CdaP56389 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CdaP56389 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CdaP56389 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CdaP56389 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CdaP56389 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CdaP56389 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CdaP56389 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CdaP56389 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CdaP56389 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CdaP56389 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CdaP56389 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CdaP56389 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CdaP56389 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CdaP56389 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CdaP56389 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CdaP56389 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CdaP56389 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CdaP56389 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CdaP56389 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CdaP56389 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CdaP56389 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CdaP56389 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CdaP56389 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CdaP56389 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CdaP56389 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CdaP56389 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CdaP56389 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CdaP56389 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CdaP56389 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CdaP56389 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CdaP56389 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CdaP56389 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CdaP56389 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CdaP56389 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CdaP56389 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CdaP56389 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CdaP56389 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CdaP56389 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CdaP56389 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CdaP56389 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CdaP56389 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CdaP56389 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms