Protein–RNA interactions for Protein: P54830

Ptpn5, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn5P54830 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25,53■■□□□ 1,68
Ptpn5P54830 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25,53■■□□□ 1,68
Ptpn5P54830 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25,53■■□□□ 1,68
Ptpn5P54830 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
Ptpn5P54830 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
Ptpn5P54830 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25,52■■□□□ 1,68
Ptpn5P54830 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,52■■□□□ 1,68
Ptpn5P54830 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25,51■■□□□ 1,67
Ptpn5P54830 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
Ptpn5P54830 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,5■■□□□ 1,67
Ptpn5P54830 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,5■■□□□ 1,67
Ptpn5P54830 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC25,49■■□□□ 1,67
Ptpn5P54830 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25,49■■□□□ 1,67
Ptpn5P54830 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25,47■■□□□ 1,67
Ptpn5P54830 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
Ptpn5P54830 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
Ptpn5P54830 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,67
Ptpn5P54830 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,66
Ptpn5P54830 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,66
Ptpn5P54830 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
Ptpn5P54830 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25,42■■□□□ 1,66
Ptpn5P54830 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25,42■■□□□ 1,66
Ptpn5P54830 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25,41■■□□□ 1,66
Ptpn5P54830 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
Ptpn5P54830 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
Ptpn5P54830 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25,41■■□□□ 1,66
Ptpn5P54830 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
Ptpn5P54830 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,4■■□□□ 1,66
Ptpn5P54830 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25,4■■□□□ 1,66
Ptpn5P54830 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
Ptpn5P54830 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,66
Ptpn5P54830 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25,39■■□□□ 1,66
Ptpn5P54830 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,66
Ptpn5P54830 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25,38■■□□□ 1,65
Ptpn5P54830 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,38■■□□□ 1,65
Ptpn5P54830 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25,36■■□□□ 1,65
Ptpn5P54830 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
Ptpn5P54830 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
Ptpn5P54830 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
Ptpn5P54830 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25,33■■□□□ 1,65
Ptpn5P54830 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,33■■□□□ 1,65
Ptpn5P54830 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,33■■□□□ 1,65
Ptpn5P54830 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,33■■□□□ 1,64
Ptpn5P54830 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25,33■■□□□ 1,64
Ptpn5P54830 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,32■■□□□ 1,64
Ptpn5P54830 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
Ptpn5P54830 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25,3■■□□□ 1,64
Ptpn5P54830 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25,29■■□□□ 1,64
Ptpn5P54830 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25,29■■□□□ 1,64
Ptpn5P54830 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
Ptpn5P54830 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25,28■■□□□ 1,64
Ptpn5P54830 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25,28■■□□□ 1,64
Ptpn5P54830 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25,27■■□□□ 1,64
Ptpn5P54830 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,26■■□□□ 1,63
Ptpn5P54830 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25,26■■□□□ 1,63
Ptpn5P54830 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,26■■□□□ 1,63
Ptpn5P54830 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,25■■□□□ 1,63
Ptpn5P54830 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25,25■■□□□ 1,63
Ptpn5P54830 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,24■■□□□ 1,63
Ptpn5P54830 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25,23■■□□□ 1,63
Ptpn5P54830 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,23■■□□□ 1,63
Ptpn5P54830 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25,23■■□□□ 1,63
Ptpn5P54830 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25,22■■□□□ 1,63
Ptpn5P54830 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25,22■■□□□ 1,63
Ptpn5P54830 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,22■■□□□ 1,63
Ptpn5P54830 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,22■■□□□ 1,63
Ptpn5P54830 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,22■■□□□ 1,63
Ptpn5P54830 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,21■■□□□ 1,63
Ptpn5P54830 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,2■■□□□ 1,63
Ptpn5P54830 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25,18■■□□□ 1,62
Ptpn5P54830 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,18■■□□□ 1,62
Ptpn5P54830 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25,17■■□□□ 1,62
Ptpn5P54830 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25,17■■□□□ 1,62
Ptpn5P54830 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25,17■■□□□ 1,62
Ptpn5P54830 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,16■■□□□ 1,62
Ptpn5P54830 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25,16■■□□□ 1,62
Ptpn5P54830 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,16■■□□□ 1,62
Ptpn5P54830 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25,15■■□□□ 1,62
Ptpn5P54830 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,15■■□□□ 1,62
Ptpn5P54830 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,15■■□□□ 1,62
Ptpn5P54830 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25,14■■□□□ 1,62
Ptpn5P54830 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25,14■■□□□ 1,62
Ptpn5P54830 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,13■■□□□ 1,61
Ptpn5P54830 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25,13■■□□□ 1,61
Ptpn5P54830 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,12■■□□□ 1,61
Ptpn5P54830 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25,11■■□□□ 1,61
Ptpn5P54830 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,11■■□□□ 1,61
Ptpn5P54830 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,11■■□□□ 1,61
Ptpn5P54830 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25,11■■□□□ 1,61
Ptpn5P54830 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,1■■□□□ 1,61
Ptpn5P54830 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25,1■■□□□ 1,61
Ptpn5P54830 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,1■■□□□ 1,61
Ptpn5P54830 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,09■■□□□ 1,61
Ptpn5P54830 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,09■■□□□ 1,61
Ptpn5P54830 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,09■■□□□ 1,61
Ptpn5P54830 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25,08■■□□□ 1,61
Ptpn5P54830 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,08■■□□□ 1,6
Ptpn5P54830 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25,07■■□□□ 1,6
Ptpn5P54830 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,07■■□□□ 1,6
Ptpn5P54830 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,06■■□□□ 1,6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,6 ms