Protein–RNA interactions for Protein: P53668

Limk1, LIM domain kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limk1P53668 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Limk1P53668 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Limk1P53668 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Limk1P53668 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Limk1P53668 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Limk1P53668 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Limk1P53668 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Limk1P53668 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Limk1P53668 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Limk1P53668 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Limk1P53668 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Limk1P53668 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Limk1P53668 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Limk1P53668 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Limk1P53668 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Limk1P53668 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Limk1P53668 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Limk1P53668 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Limk1P53668 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Limk1P53668 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Limk1P53668 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Limk1P53668 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Limk1P53668 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Limk1P53668 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Limk1P53668 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Limk1P53668 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Limk1P53668 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Limk1P53668 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Limk1P53668 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Limk1P53668 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Limk1P53668 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Limk1P53668 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Limk1P53668 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Limk1P53668 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Limk1P53668 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Limk1P53668 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Limk1P53668 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Limk1P53668 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Limk1P53668 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Limk1P53668 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Limk1P53668 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Limk1P53668 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Limk1P53668 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Limk1P53668 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Limk1P53668 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Limk1P53668 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Limk1P53668 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Limk1P53668 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Limk1P53668 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Limk1P53668 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Limk1P53668 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Limk1P53668 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Limk1P53668 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Limk1P53668 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Limk1P53668 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Limk1P53668 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Limk1P53668 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Limk1P53668 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Limk1P53668 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Limk1P53668 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Limk1P53668 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Limk1P53668 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Limk1P53668 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Limk1P53668 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Limk1P53668 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Limk1P53668 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Limk1P53668 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Limk1P53668 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Limk1P53668 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Limk1P53668 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Limk1P53668 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Limk1P53668 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Limk1P53668 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Limk1P53668 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Limk1P53668 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Limk1P53668 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Limk1P53668 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Limk1P53668 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Limk1P53668 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Limk1P53668 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Limk1P53668 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Limk1P53668 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Limk1P53668 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Limk1P53668 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Limk1P53668 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Limk1P53668 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Limk1P53668 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Limk1P53668 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Limk1P53668 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Limk1P53668 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Limk1P53668 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Limk1P53668 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Limk1P53668 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Limk1P53668 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Limk1P53668 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Limk1P53668 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Limk1P53668 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Limk1P53668 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Limk1P53668 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Limk1P53668 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.1 ms