Protein–RNA interactions for Protein: P51944

Ccnf, Cyclin-F, mousemouse

Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnfP51944 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CcnfP51944 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CcnfP51944 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CcnfP51944 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CcnfP51944 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CcnfP51944 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CcnfP51944 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CcnfP51944 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CcnfP51944 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CcnfP51944 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CcnfP51944 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CcnfP51944 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CcnfP51944 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CcnfP51944 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CcnfP51944 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CcnfP51944 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CcnfP51944 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CcnfP51944 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CcnfP51944 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CcnfP51944 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CcnfP51944 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CcnfP51944 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CcnfP51944 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CcnfP51944 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CcnfP51944 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CcnfP51944 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CcnfP51944 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CcnfP51944 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CcnfP51944 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CcnfP51944 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CcnfP51944 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CcnfP51944 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CcnfP51944 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CcnfP51944 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CcnfP51944 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CcnfP51944 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CcnfP51944 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CcnfP51944 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CcnfP51944 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CcnfP51944 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CcnfP51944 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CcnfP51944 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CcnfP51944 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CcnfP51944 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CcnfP51944 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CcnfP51944 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CcnfP51944 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CcnfP51944 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CcnfP51944 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CcnfP51944 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CcnfP51944 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CcnfP51944 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CcnfP51944 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CcnfP51944 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CcnfP51944 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CcnfP51944 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CcnfP51944 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CcnfP51944 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CcnfP51944 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CcnfP51944 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CcnfP51944 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CcnfP51944 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CcnfP51944 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CcnfP51944 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CcnfP51944 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CcnfP51944 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CcnfP51944 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CcnfP51944 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CcnfP51944 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CcnfP51944 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CcnfP51944 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CcnfP51944 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CcnfP51944 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CcnfP51944 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CcnfP51944 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CcnfP51944 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CcnfP51944 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CcnfP51944 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CcnfP51944 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CcnfP51944 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CcnfP51944 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CcnfP51944 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CcnfP51944 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CcnfP51944 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CcnfP51944 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CcnfP51944 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CcnfP51944 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CcnfP51944 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CcnfP51944 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CcnfP51944 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CcnfP51944 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CcnfP51944 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CcnfP51944 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CcnfP51944 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CcnfP51944 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CcnfP51944 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CcnfP51944 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CcnfP51944 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CcnfP51944 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CcnfP51944 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms