Protein–RNA interactions for Protein: P51943

Ccna2, Cyclin-A2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccna2P51943 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccna2P51943 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccna2P51943 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccna2P51943 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccna2P51943 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccna2P51943 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccna2P51943 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccna2P51943 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccna2P51943 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccna2P51943 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccna2P51943 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccna2P51943 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccna2P51943 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccna2P51943 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccna2P51943 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccna2P51943 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccna2P51943 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccna2P51943 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccna2P51943 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccna2P51943 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccna2P51943 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccna2P51943 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccna2P51943 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccna2P51943 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccna2P51943 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccna2P51943 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccna2P51943 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccna2P51943 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccna2P51943 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccna2P51943 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccna2P51943 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccna2P51943 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccna2P51943 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccna2P51943 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccna2P51943 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccna2P51943 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccna2P51943 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccna2P51943 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccna2P51943 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccna2P51943 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccna2P51943 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccna2P51943 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccna2P51943 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccna2P51943 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccna2P51943 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccna2P51943 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccna2P51943 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccna2P51943 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccna2P51943 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccna2P51943 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccna2P51943 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccna2P51943 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccna2P51943 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccna2P51943 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccna2P51943 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccna2P51943 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccna2P51943 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccna2P51943 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccna2P51943 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccna2P51943 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccna2P51943 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccna2P51943 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccna2P51943 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccna2P51943 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccna2P51943 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccna2P51943 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccna2P51943 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccna2P51943 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccna2P51943 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccna2P51943 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccna2P51943 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccna2P51943 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccna2P51943 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccna2P51943 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccna2P51943 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccna2P51943 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccna2P51943 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccna2P51943 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccna2P51943 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccna2P51943 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccna2P51943 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccna2P51943 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccna2P51943 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccna2P51943 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccna2P51943 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccna2P51943 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccna2P51943 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccna2P51943 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccna2P51943 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccna2P51943 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccna2P51943 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccna2P51943 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccna2P51943 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccna2P51943 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccna2P51943 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccna2P51943 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccna2P51943 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccna2P51943 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccna2P51943 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccna2P51943 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms