Protein–RNA interactions for Protein: P51906

Slc1a1, Excitatory amino acid transporter 3, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc1a1P51906 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Slc1a1P51906 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Slc1a1P51906 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Slc1a1P51906 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Slc1a1P51906 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Slc1a1P51906 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Slc1a1P51906 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Slc1a1P51906 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Slc1a1P51906 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Slc1a1P51906 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Slc1a1P51906 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Slc1a1P51906 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Slc1a1P51906 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Slc1a1P51906 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Slc1a1P51906 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Slc1a1P51906 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Slc1a1P51906 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Slc1a1P51906 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Slc1a1P51906 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Slc1a1P51906 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Slc1a1P51906 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Slc1a1P51906 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Slc1a1P51906 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Slc1a1P51906 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Slc1a1P51906 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Slc1a1P51906 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Slc1a1P51906 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Slc1a1P51906 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Slc1a1P51906 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Slc1a1P51906 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Slc1a1P51906 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Slc1a1P51906 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Slc1a1P51906 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Slc1a1P51906 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Slc1a1P51906 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Slc1a1P51906 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Slc1a1P51906 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Slc1a1P51906 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Slc1a1P51906 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Slc1a1P51906 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Slc1a1P51906 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Slc1a1P51906 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Slc1a1P51906 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Slc1a1P51906 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Slc1a1P51906 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Slc1a1P51906 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Slc1a1P51906 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Slc1a1P51906 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Slc1a1P51906 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Slc1a1P51906 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Slc1a1P51906 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Slc1a1P51906 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Slc1a1P51906 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Slc1a1P51906 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Slc1a1P51906 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Slc1a1P51906 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Slc1a1P51906 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Slc1a1P51906 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Slc1a1P51906 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Slc1a1P51906 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Slc1a1P51906 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Slc1a1P51906 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Slc1a1P51906 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Slc1a1P51906 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Slc1a1P51906 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Slc1a1P51906 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Slc1a1P51906 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Slc1a1P51906 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Slc1a1P51906 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Slc1a1P51906 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Slc1a1P51906 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Slc1a1P51906 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Slc1a1P51906 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Slc1a1P51906 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Slc1a1P51906 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Slc1a1P51906 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Slc1a1P51906 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Slc1a1P51906 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Slc1a1P51906 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Slc1a1P51906 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Slc1a1P51906 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Slc1a1P51906 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Slc1a1P51906 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Slc1a1P51906 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Slc1a1P51906 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Slc1a1P51906 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Slc1a1P51906 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Slc1a1P51906 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Slc1a1P51906 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Slc1a1P51906 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Slc1a1P51906 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Slc1a1P51906 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Slc1a1P51906 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Slc1a1P51906 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Slc1a1P51906 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Slc1a1P51906 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Slc1a1P51906 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Slc1a1P51906 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Slc1a1P51906 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Slc1a1P51906 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms