Protein–RNA interactions for Protein: P50752

Tnnt2, Troponin T, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt2P50752 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Tnnt2P50752 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Tnnt2P50752 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Tnnt2P50752 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Tnnt2P50752 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Tnnt2P50752 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Tnnt2P50752 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Tnnt2P50752 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tnnt2P50752 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tnnt2P50752 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tnnt2P50752 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tnnt2P50752 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Tnnt2P50752 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Tnnt2P50752 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Tnnt2P50752 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Tnnt2P50752 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Tnnt2P50752 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Tnnt2P50752 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Tnnt2P50752 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Tnnt2P50752 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Tnnt2P50752 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Tnnt2P50752 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tnnt2P50752 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tnnt2P50752 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tnnt2P50752 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tnnt2P50752 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tnnt2P50752 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tnnt2P50752 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tnnt2P50752 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tnnt2P50752 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Tnnt2P50752 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Tnnt2P50752 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Tnnt2P50752 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Tnnt2P50752 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Tnnt2P50752 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Tnnt2P50752 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Tnnt2P50752 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Tnnt2P50752 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Tnnt2P50752 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Tnnt2P50752 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Tnnt2P50752 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Tnnt2P50752 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Tnnt2P50752 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Tnnt2P50752 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Tnnt2P50752 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Tnnt2P50752 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Tnnt2P50752 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Tnnt2P50752 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Tnnt2P50752 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Tnnt2P50752 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Tnnt2P50752 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Tnnt2P50752 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Tnnt2P50752 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tnnt2P50752 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tnnt2P50752 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tnnt2P50752 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tnnt2P50752 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tnnt2P50752 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Tnnt2P50752 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Tnnt2P50752 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Tnnt2P50752 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Tnnt2P50752 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Tnnt2P50752 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Tnnt2P50752 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Tnnt2P50752 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Tnnt2P50752 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Tnnt2P50752 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tnnt2P50752 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Tnnt2P50752 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Tnnt2P50752 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Tnnt2P50752 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tnnt2P50752 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tnnt2P50752 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tnnt2P50752 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tnnt2P50752 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tnnt2P50752 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tnnt2P50752 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tnnt2P50752 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tnnt2P50752 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tnnt2P50752 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tnnt2P50752 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tnnt2P50752 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tnnt2P50752 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tnnt2P50752 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Tnnt2P50752 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Tnnt2P50752 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Tnnt2P50752 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Tnnt2P50752 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tnnt2P50752 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tnnt2P50752 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tnnt2P50752 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tnnt2P50752 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tnnt2P50752 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tnnt2P50752 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tnnt2P50752 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tnnt2P50752 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tnnt2P50752 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Tnnt2P50752 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tnnt2P50752 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Tnnt2P50752 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms