Protein–RNA interactions for Protein: P49025

Cit, Citron Rho-interacting kinase, mousemouse

Predictions only

Length 2,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CitP49025 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CitP49025 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CitP49025 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CitP49025 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CitP49025 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CitP49025 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CitP49025 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CitP49025 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CitP49025 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CitP49025 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CitP49025 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CitP49025 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CitP49025 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CitP49025 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CitP49025 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CitP49025 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CitP49025 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CitP49025 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CitP49025 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CitP49025 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CitP49025 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CitP49025 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CitP49025 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CitP49025 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CitP49025 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CitP49025 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CitP49025 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CitP49025 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CitP49025 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CitP49025 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CitP49025 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CitP49025 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CitP49025 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
CitP49025 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CitP49025 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CitP49025 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CitP49025 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CitP49025 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CitP49025 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CitP49025 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CitP49025 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CitP49025 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CitP49025 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CitP49025 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CitP49025 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CitP49025 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CitP49025 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CitP49025 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CitP49025 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CitP49025 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CitP49025 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CitP49025 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CitP49025 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CitP49025 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CitP49025 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CitP49025 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CitP49025 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CitP49025 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CitP49025 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CitP49025 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CitP49025 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CitP49025 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CitP49025 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CitP49025 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CitP49025 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CitP49025 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CitP49025 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
CitP49025 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CitP49025 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CitP49025 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CitP49025 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CitP49025 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CitP49025 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CitP49025 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CitP49025 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CitP49025 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CitP49025 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CitP49025 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CitP49025 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CitP49025 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CitP49025 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CitP49025 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CitP49025 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CitP49025 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CitP49025 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CitP49025 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CitP49025 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CitP49025 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CitP49025 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CitP49025 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CitP49025 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CitP49025 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CitP49025 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CitP49025 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CitP49025 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CitP49025 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CitP49025 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CitP49025 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CitP49025 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CitP49025 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.5 ms