Protein–RNA interactions for Protein: P48772

Cox8b, Cytochrome c oxidase subunit 8B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 70 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox8bP48772 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cox8bP48772 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cox8bP48772 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cox8bP48772 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cox8bP48772 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cox8bP48772 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cox8bP48772 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cox8bP48772 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cox8bP48772 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cox8bP48772 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cox8bP48772 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cox8bP48772 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cox8bP48772 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cox8bP48772 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cox8bP48772 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cox8bP48772 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cox8bP48772 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cox8bP48772 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cox8bP48772 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cox8bP48772 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cox8bP48772 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cox8bP48772 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cox8bP48772 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cox8bP48772 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cox8bP48772 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cox8bP48772 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cox8bP48772 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cox8bP48772 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cox8bP48772 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cox8bP48772 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Cox8bP48772 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cox8bP48772 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cox8bP48772 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cox8bP48772 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cox8bP48772 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cox8bP48772 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cox8bP48772 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cox8bP48772 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cox8bP48772 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Cox8bP48772 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cox8bP48772 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cox8bP48772 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cox8bP48772 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cox8bP48772 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cox8bP48772 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cox8bP48772 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cox8bP48772 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cox8bP48772 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cox8bP48772 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cox8bP48772 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cox8bP48772 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cox8bP48772 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cox8bP48772 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cox8bP48772 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cox8bP48772 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cox8bP48772 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cox8bP48772 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cox8bP48772 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cox8bP48772 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cox8bP48772 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cox8bP48772 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cox8bP48772 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cox8bP48772 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cox8bP48772 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cox8bP48772 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cox8bP48772 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cox8bP48772 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cox8bP48772 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cox8bP48772 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cox8bP48772 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cox8bP48772 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cox8bP48772 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cox8bP48772 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cox8bP48772 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cox8bP48772 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cox8bP48772 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cox8bP48772 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cox8bP48772 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cox8bP48772 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cox8bP48772 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cox8bP48772 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cox8bP48772 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cox8bP48772 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cox8bP48772 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cox8bP48772 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Cox8bP48772 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Cox8bP48772 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cox8bP48772 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cox8bP48772 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cox8bP48772 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cox8bP48772 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Cox8bP48772 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cox8bP48772 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cox8bP48772 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cox8bP48772 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cox8bP48772 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cox8bP48772 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cox8bP48772 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cox8bP48772 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cox8bP48772 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms