Protein–RNA interactions for Protein: P48410

Abcd1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd1P48410 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Abcd1P48410 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Abcd1P48410 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Abcd1P48410 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Abcd1P48410 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Abcd1P48410 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Abcd1P48410 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Abcd1P48410 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Abcd1P48410 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Abcd1P48410 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Abcd1P48410 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Abcd1P48410 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Abcd1P48410 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Abcd1P48410 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Abcd1P48410 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Abcd1P48410 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Abcd1P48410 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Abcd1P48410 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Abcd1P48410 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Abcd1P48410 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Abcd1P48410 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Abcd1P48410 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Abcd1P48410 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Abcd1P48410 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Abcd1P48410 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Abcd1P48410 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Abcd1P48410 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Abcd1P48410 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Abcd1P48410 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Abcd1P48410 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Abcd1P48410 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Abcd1P48410 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Abcd1P48410 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Abcd1P48410 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Abcd1P48410 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Abcd1P48410 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Abcd1P48410 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Abcd1P48410 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Abcd1P48410 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Abcd1P48410 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Abcd1P48410 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Abcd1P48410 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.92
Abcd1P48410 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Abcd1P48410 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Abcd1P48410 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Abcd1P48410 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Abcd1P48410 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Abcd1P48410 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Abcd1P48410 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Abcd1P48410 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Abcd1P48410 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Abcd1P48410 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Abcd1P48410 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Abcd1P48410 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Abcd1P48410 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Abcd1P48410 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Abcd1P48410 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Abcd1P48410 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Abcd1P48410 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Abcd1P48410 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Abcd1P48410 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Abcd1P48410 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Abcd1P48410 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Abcd1P48410 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Abcd1P48410 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Abcd1P48410 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Abcd1P48410 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Abcd1P48410 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Abcd1P48410 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Abcd1P48410 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Abcd1P48410 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Abcd1P48410 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Abcd1P48410 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Abcd1P48410 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Abcd1P48410 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Abcd1P48410 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Abcd1P48410 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Abcd1P48410 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Abcd1P48410 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Abcd1P48410 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Abcd1P48410 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Abcd1P48410 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Abcd1P48410 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Abcd1P48410 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Abcd1P48410 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Abcd1P48410 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Abcd1P48410 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Abcd1P48410 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Abcd1P48410 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Abcd1P48410 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Abcd1P48410 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Abcd1P48410 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Abcd1P48410 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Abcd1P48410 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Abcd1P48410 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Abcd1P48410 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Abcd1P48410 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Abcd1P48410 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Abcd1P48410 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Abcd1P48410 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms