Protein–RNA interactions for Protein: P47878

Igfbp3, Insulin-like growth factor-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igfbp3P47878 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Igfbp3P47878 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Igfbp3P47878 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Igfbp3P47878 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Igfbp3P47878 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Igfbp3P47878 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Igfbp3P47878 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Igfbp3P47878 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Igfbp3P47878 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Igfbp3P47878 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Igfbp3P47878 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Igfbp3P47878 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Igfbp3P47878 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Igfbp3P47878 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Igfbp3P47878 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Igfbp3P47878 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Igfbp3P47878 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Igfbp3P47878 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Igfbp3P47878 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Igfbp3P47878 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Igfbp3P47878 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Igfbp3P47878 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Igfbp3P47878 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Igfbp3P47878 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Igfbp3P47878 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Igfbp3P47878 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Igfbp3P47878 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Igfbp3P47878 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Igfbp3P47878 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Igfbp3P47878 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Igfbp3P47878 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Igfbp3P47878 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Igfbp3P47878 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Igfbp3P47878 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Igfbp3P47878 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Igfbp3P47878 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Igfbp3P47878 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Igfbp3P47878 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Igfbp3P47878 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Igfbp3P47878 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Igfbp3P47878 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Igfbp3P47878 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Igfbp3P47878 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Igfbp3P47878 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Igfbp3P47878 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Igfbp3P47878 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Igfbp3P47878 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Igfbp3P47878 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Igfbp3P47878 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Igfbp3P47878 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Igfbp3P47878 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Igfbp3P47878 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Igfbp3P47878 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Igfbp3P47878 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Igfbp3P47878 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Igfbp3P47878 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Igfbp3P47878 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Igfbp3P47878 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Igfbp3P47878 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Igfbp3P47878 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Igfbp3P47878 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Igfbp3P47878 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Igfbp3P47878 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Igfbp3P47878 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Igfbp3P47878 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Igfbp3P47878 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Igfbp3P47878 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Igfbp3P47878 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Igfbp3P47878 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Igfbp3P47878 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Igfbp3P47878 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Igfbp3P47878 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Igfbp3P47878 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Igfbp3P47878 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Igfbp3P47878 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Igfbp3P47878 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Igfbp3P47878 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Igfbp3P47878 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Igfbp3P47878 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Igfbp3P47878 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Igfbp3P47878 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Igfbp3P47878 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Igfbp3P47878 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Igfbp3P47878 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Igfbp3P47878 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Igfbp3P47878 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Igfbp3P47878 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Igfbp3P47878 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Igfbp3P47878 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Igfbp3P47878 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Igfbp3P47878 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Igfbp3P47878 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Igfbp3P47878 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Igfbp3P47878 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Igfbp3P47878 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Igfbp3P47878 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Igfbp3P47878 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Igfbp3P47878 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Igfbp3P47878 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Igfbp3P47878 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms