Protein–RNA interactions for Protein: P47753

Capza1, F-actin-capping protein subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capza1P47753 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Capza1P47753 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Capza1P47753 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Capza1P47753 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Capza1P47753 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Capza1P47753 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Capza1P47753 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Capza1P47753 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Capza1P47753 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Capza1P47753 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Capza1P47753 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Capza1P47753 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Capza1P47753 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Capza1P47753 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Capza1P47753 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Capza1P47753 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Capza1P47753 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Capza1P47753 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Capza1P47753 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Capza1P47753 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Capza1P47753 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Capza1P47753 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Capza1P47753 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Capza1P47753 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Capza1P47753 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Capza1P47753 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Capza1P47753 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Capza1P47753 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Capza1P47753 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Capza1P47753 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Capza1P47753 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Capza1P47753 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Capza1P47753 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Capza1P47753 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Capza1P47753 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Capza1P47753 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Capza1P47753 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Capza1P47753 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Capza1P47753 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Capza1P47753 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Capza1P47753 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Capza1P47753 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Capza1P47753 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Capza1P47753 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Capza1P47753 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Capza1P47753 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Capza1P47753 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Capza1P47753 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Capza1P47753 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Capza1P47753 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Capza1P47753 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Capza1P47753 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Capza1P47753 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Capza1P47753 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Capza1P47753 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Capza1P47753 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Capza1P47753 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Capza1P47753 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Capza1P47753 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Capza1P47753 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Capza1P47753 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Capza1P47753 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Capza1P47753 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Capza1P47753 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Capza1P47753 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Capza1P47753 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Capza1P47753 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Capza1P47753 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Capza1P47753 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Capza1P47753 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Capza1P47753 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Capza1P47753 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Capza1P47753 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Capza1P47753 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Capza1P47753 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Capza1P47753 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Capza1P47753 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Capza1P47753 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Capza1P47753 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Capza1P47753 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Capza1P47753 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Capza1P47753 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Capza1P47753 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Capza1P47753 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Capza1P47753 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Capza1P47753 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Capza1P47753 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Capza1P47753 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Capza1P47753 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Capza1P47753 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Capza1P47753 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Capza1P47753 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Capza1P47753 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Capza1P47753 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Capza1P47753 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Capza1P47753 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Capza1P47753 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Capza1P47753 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Capza1P47753 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Capza1P47753 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.4 ms