Protein–RNA interactions for Protein: P43247

Msh2, DNA mismatch repair protein Msh2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msh2P43247 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Msh2P43247 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Msh2P43247 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Msh2P43247 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Msh2P43247 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Msh2P43247 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Msh2P43247 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Msh2P43247 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Msh2P43247 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Msh2P43247 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Msh2P43247 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Msh2P43247 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Msh2P43247 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Msh2P43247 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Msh2P43247 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Msh2P43247 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Msh2P43247 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Msh2P43247 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Msh2P43247 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Msh2P43247 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Msh2P43247 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Msh2P43247 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Msh2P43247 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Msh2P43247 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Msh2P43247 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Msh2P43247 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Msh2P43247 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Msh2P43247 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Msh2P43247 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Msh2P43247 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Msh2P43247 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Msh2P43247 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Msh2P43247 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Msh2P43247 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Msh2P43247 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Msh2P43247 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Msh2P43247 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Msh2P43247 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Msh2P43247 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Msh2P43247 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Msh2P43247 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Msh2P43247 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Msh2P43247 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Msh2P43247 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Msh2P43247 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Msh2P43247 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Msh2P43247 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Msh2P43247 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Msh2P43247 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Msh2P43247 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Msh2P43247 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Msh2P43247 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Msh2P43247 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Msh2P43247 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Msh2P43247 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Msh2P43247 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Msh2P43247 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Msh2P43247 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Msh2P43247 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Msh2P43247 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Msh2P43247 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Msh2P43247 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Msh2P43247 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Msh2P43247 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Msh2P43247 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Msh2P43247 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Msh2P43247 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Msh2P43247 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Msh2P43247 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Msh2P43247 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Msh2P43247 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Msh2P43247 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Msh2P43247 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Msh2P43247 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Msh2P43247 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Msh2P43247 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Msh2P43247 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Msh2P43247 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Msh2P43247 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Msh2P43247 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Msh2P43247 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Msh2P43247 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Msh2P43247 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Msh2P43247 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Msh2P43247 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Msh2P43247 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Msh2P43247 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Msh2P43247 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Msh2P43247 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Msh2P43247 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Msh2P43247 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Msh2P43247 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Msh2P43247 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Msh2P43247 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Msh2P43247 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Msh2P43247 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Msh2P43247 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Msh2P43247 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Msh2P43247 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Msh2P43247 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms