Protein–RNA interactions for Protein: P42580

Nkx1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-2P42580 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Nkx1-2P42580 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Nkx1-2P42580 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Nkx1-2P42580 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Nkx1-2P42580 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Nkx1-2P42580 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
Nkx1-2P42580 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
Nkx1-2P42580 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
Nkx1-2P42580 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
Nkx1-2P42580 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Nkx1-2P42580 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Nkx1-2P42580 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Nkx1-2P42580 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Nkx1-2P42580 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Nkx1-2P42580 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
Nkx1-2P42580 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Nkx1-2P42580 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Nkx1-2P42580 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Nkx1-2P42580 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Nkx1-2P42580 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Nkx1-2P42580 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Nkx1-2P42580 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Nkx1-2P42580 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Nkx1-2P42580 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Nkx1-2P42580 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Nkx1-2P42580 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Nkx1-2P42580 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Nkx1-2P42580 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Nkx1-2P42580 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Nkx1-2P42580 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Nkx1-2P42580 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Nkx1-2P42580 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
Nkx1-2P42580 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Nkx1-2P42580 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Nkx1-2P42580 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Nkx1-2P42580 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Nkx1-2P42580 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Nkx1-2P42580 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Nkx1-2P42580 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
Nkx1-2P42580 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Nkx1-2P42580 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Nkx1-2P42580 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
Nkx1-2P42580 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
Nkx1-2P42580 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Nkx1-2P42580 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Nkx1-2P42580 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Nkx1-2P42580 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Nkx1-2P42580 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Nkx1-2P42580 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Nkx1-2P42580 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Nkx1-2P42580 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Nkx1-2P42580 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Nkx1-2P42580 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
Nkx1-2P42580 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Nkx1-2P42580 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Nkx1-2P42580 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Nkx1-2P42580 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Nkx1-2P42580 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Nkx1-2P42580 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Nkx1-2P42580 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Nkx1-2P42580 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Nkx1-2P42580 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Nkx1-2P42580 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Nkx1-2P42580 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Nkx1-2P42580 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Nkx1-2P42580 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Nkx1-2P42580 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Nkx1-2P42580 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Nkx1-2P42580 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Nkx1-2P42580 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Nkx1-2P42580 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Nkx1-2P42580 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Nkx1-2P42580 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Nkx1-2P42580 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Nkx1-2P42580 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Nkx1-2P42580 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Nkx1-2P42580 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Nkx1-2P42580 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Nkx1-2P42580 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Nkx1-2P42580 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Nkx1-2P42580 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Nkx1-2P42580 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Nkx1-2P42580 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Nkx1-2P42580 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Nkx1-2P42580 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
Nkx1-2P42580 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Nkx1-2P42580 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC30.2■■■□□ 2.43
Nkx1-2P42580 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Nkx1-2P42580 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Nkx1-2P42580 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Nkx1-2P42580 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Nkx1-2P42580 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Nkx1-2P42580 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Nkx1-2P42580 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Nkx1-2P42580 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Nkx1-2P42580 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Nkx1-2P42580 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Nkx1-2P42580 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Nkx1-2P42580 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Nkx1-2P42580 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms