Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VhlP40338 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VhlP40338 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VhlP40338 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VhlP40338 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VhlP40338 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VhlP40338 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VhlP40338 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VhlP40338 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
VhlP40338 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
VhlP40338 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VhlP40338 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
VhlP40338 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VhlP40338 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VhlP40338 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
VhlP40338 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VhlP40338 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
VhlP40338 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
VhlP40338 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VhlP40338 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
VhlP40338 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VhlP40338 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VhlP40338 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
VhlP40338 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VhlP40338 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VhlP40338 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VhlP40338 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VhlP40338 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VhlP40338 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VhlP40338 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VhlP40338 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VhlP40338 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VhlP40338 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VhlP40338 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VhlP40338 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VhlP40338 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VhlP40338 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
VhlP40338 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
VhlP40338 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
VhlP40338 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
VhlP40338 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
VhlP40338 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
VhlP40338 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
VhlP40338 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VhlP40338 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VhlP40338 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VhlP40338 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VhlP40338 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VhlP40338 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VhlP40338 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VhlP40338 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VhlP40338 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VhlP40338 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VhlP40338 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
VhlP40338 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
VhlP40338 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VhlP40338 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VhlP40338 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VhlP40338 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
VhlP40338 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VhlP40338 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
VhlP40338 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
VhlP40338 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VhlP40338 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
VhlP40338 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
VhlP40338 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VhlP40338 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VhlP40338 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VhlP40338 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VhlP40338 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VhlP40338 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
VhlP40338 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VhlP40338 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VhlP40338 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VhlP40338 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VhlP40338 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VhlP40338 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VhlP40338 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VhlP40338 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
VhlP40338 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
VhlP40338 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
VhlP40338 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
VhlP40338 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
VhlP40338 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
VhlP40338 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
VhlP40338 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
VhlP40338 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
VhlP40338 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
VhlP40338 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
VhlP40338 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
VhlP40338 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
VhlP40338 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
VhlP40338 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
VhlP40338 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
VhlP40338 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
VhlP40338 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VhlP40338 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
VhlP40338 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
VhlP40338 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
VhlP40338 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms