Protein–RNA interactions for Protein: P39749

Fen1, Flap endonuclease 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fen1P39749 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fen1P39749 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fen1P39749 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Fen1P39749 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fen1P39749 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fen1P39749 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fen1P39749 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fen1P39749 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fen1P39749 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Fen1P39749 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fen1P39749 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fen1P39749 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fen1P39749 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Fen1P39749 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Fen1P39749 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fen1P39749 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fen1P39749 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fen1P39749 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fen1P39749 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Fen1P39749 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fen1P39749 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Fen1P39749 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Fen1P39749 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Fen1P39749 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fen1P39749 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fen1P39749 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fen1P39749 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Fen1P39749 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fen1P39749 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fen1P39749 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fen1P39749 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fen1P39749 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Fen1P39749 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fen1P39749 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fen1P39749 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Fen1P39749 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fen1P39749 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fen1P39749 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fen1P39749 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fen1P39749 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fen1P39749 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fen1P39749 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fen1P39749 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fen1P39749 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fen1P39749 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fen1P39749 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fen1P39749 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fen1P39749 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fen1P39749 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fen1P39749 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fen1P39749 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fen1P39749 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fen1P39749 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fen1P39749 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fen1P39749 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Fen1P39749 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fen1P39749 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fen1P39749 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fen1P39749 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fen1P39749 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fen1P39749 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fen1P39749 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fen1P39749 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Fen1P39749 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fen1P39749 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Fen1P39749 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fen1P39749 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fen1P39749 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fen1P39749 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Fen1P39749 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fen1P39749 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fen1P39749 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fen1P39749 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fen1P39749 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fen1P39749 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fen1P39749 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fen1P39749 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Fen1P39749 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fen1P39749 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fen1P39749 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fen1P39749 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fen1P39749 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fen1P39749 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fen1P39749 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fen1P39749 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fen1P39749 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fen1P39749 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Fen1P39749 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fen1P39749 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fen1P39749 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fen1P39749 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fen1P39749 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Fen1P39749 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Fen1P39749 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fen1P39749 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fen1P39749 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fen1P39749 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fen1P39749 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fen1P39749 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fen1P39749 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms