Protein–RNA interactions for Protein: P35689

Ercc5, DNA repair protein complementing XP-G cells homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc5P35689 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ercc5P35689 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ercc5P35689 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ercc5P35689 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ercc5P35689 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Ercc5P35689 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ercc5P35689 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ercc5P35689 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ercc5P35689 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Ercc5P35689 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ercc5P35689 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ercc5P35689 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ercc5P35689 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ercc5P35689 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ercc5P35689 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ercc5P35689 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ercc5P35689 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ercc5P35689 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ercc5P35689 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ercc5P35689 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ercc5P35689 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ercc5P35689 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ercc5P35689 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ercc5P35689 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ercc5P35689 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ercc5P35689 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ercc5P35689 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Ercc5P35689 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ercc5P35689 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ercc5P35689 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ercc5P35689 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ercc5P35689 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ercc5P35689 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Ercc5P35689 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Ercc5P35689 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Ercc5P35689 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ercc5P35689 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ercc5P35689 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ercc5P35689 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ercc5P35689 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ercc5P35689 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ercc5P35689 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ercc5P35689 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ercc5P35689 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Ercc5P35689 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ercc5P35689 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ercc5P35689 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ercc5P35689 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ercc5P35689 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ercc5P35689 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ercc5P35689 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Ercc5P35689 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ercc5P35689 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ercc5P35689 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ercc5P35689 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ercc5P35689 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ercc5P35689 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Ercc5P35689 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
Ercc5P35689 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ercc5P35689 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ercc5P35689 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ercc5P35689 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ercc5P35689 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ercc5P35689 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ercc5P35689 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ercc5P35689 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ercc5P35689 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ercc5P35689 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ercc5P35689 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ercc5P35689 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Ercc5P35689 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ercc5P35689 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ercc5P35689 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ercc5P35689 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ercc5P35689 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ercc5P35689 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ercc5P35689 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ercc5P35689 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ercc5P35689 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ercc5P35689 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ercc5P35689 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ercc5P35689 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ercc5P35689 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ercc5P35689 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ercc5P35689 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ercc5P35689 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ercc5P35689 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ercc5P35689 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ercc5P35689 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ercc5P35689 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ercc5P35689 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ercc5P35689 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ercc5P35689 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Ercc5P35689 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Ercc5P35689 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ercc5P35689 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ercc5P35689 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ercc5P35689 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ercc5P35689 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ercc5P35689 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms