Protein–RNA interactions for Protein: P35639

Ddit3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddit3P35639 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ddit3P35639 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ddit3P35639 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Ddit3P35639 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Ddit3P35639 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Ddit3P35639 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Ddit3P35639 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Ddit3P35639 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Ddit3P35639 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Ddit3P35639 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Ddit3P35639 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
Ddit3P35639 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ddit3P35639 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Ddit3P35639 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Ddit3P35639 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Ddit3P35639 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Ddit3P35639 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Ddit3P35639 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Ddit3P35639 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Ddit3P35639 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ddit3P35639 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ddit3P35639 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ddit3P35639 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ddit3P35639 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ddit3P35639 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ddit3P35639 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ddit3P35639 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ddit3P35639 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ddit3P35639 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Ddit3P35639 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Ddit3P35639 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Ddit3P35639 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Ddit3P35639 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Ddit3P35639 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ddit3P35639 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Ddit3P35639 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Ddit3P35639 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Ddit3P35639 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Ddit3P35639 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ddit3P35639 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ddit3P35639 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ddit3P35639 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ddit3P35639 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ddit3P35639 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ddit3P35639 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ddit3P35639 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ddit3P35639 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ddit3P35639 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ddit3P35639 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ddit3P35639 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ddit3P35639 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Ddit3P35639 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ddit3P35639 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ddit3P35639 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ddit3P35639 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ddit3P35639 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ddit3P35639 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ddit3P35639 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Ddit3P35639 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Ddit3P35639 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Ddit3P35639 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Ddit3P35639 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Ddit3P35639 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Ddit3P35639 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
Ddit3P35639 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ddit3P35639 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ddit3P35639 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ddit3P35639 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ddit3P35639 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ddit3P35639 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ddit3P35639 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ddit3P35639 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Ddit3P35639 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ddit3P35639 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ddit3P35639 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ddit3P35639 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ddit3P35639 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ddit3P35639 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ddit3P35639 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ddit3P35639 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ddit3P35639 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ddit3P35639 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ddit3P35639 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ddit3P35639 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ddit3P35639 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ddit3P35639 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ddit3P35639 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ddit3P35639 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ddit3P35639 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ddit3P35639 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ddit3P35639 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ddit3P35639 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ddit3P35639 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ddit3P35639 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ddit3P35639 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ddit3P35639 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ddit3P35639 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ddit3P35639 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ddit3P35639 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ddit3P35639 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms