Protein–RNA interactions for Protein: P35375

Ptger1, Prostaglandin E2 receptor EP1 subtype, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptger1P35375 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ptger1P35375 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ptger1P35375 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ptger1P35375 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ptger1P35375 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ptger1P35375 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Ptger1P35375 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Ptger1P35375 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ptger1P35375 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ptger1P35375 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ptger1P35375 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ptger1P35375 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ptger1P35375 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Ptger1P35375 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ptger1P35375 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ptger1P35375 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ptger1P35375 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ptger1P35375 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ptger1P35375 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ptger1P35375 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ptger1P35375 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ptger1P35375 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ptger1P35375 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ptger1P35375 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ptger1P35375 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ptger1P35375 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ptger1P35375 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ptger1P35375 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ptger1P35375 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ptger1P35375 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ptger1P35375 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ptger1P35375 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ptger1P35375 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ptger1P35375 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ptger1P35375 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ptger1P35375 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ptger1P35375 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ptger1P35375 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ptger1P35375 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ptger1P35375 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ptger1P35375 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ptger1P35375 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ptger1P35375 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ptger1P35375 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Ptger1P35375 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ptger1P35375 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ptger1P35375 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ptger1P35375 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ptger1P35375 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ptger1P35375 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ptger1P35375 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ptger1P35375 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ptger1P35375 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ptger1P35375 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ptger1P35375 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Ptger1P35375 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ptger1P35375 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ptger1P35375 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ptger1P35375 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ptger1P35375 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ptger1P35375 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ptger1P35375 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ptger1P35375 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ptger1P35375 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ptger1P35375 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ptger1P35375 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ptger1P35375 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ptger1P35375 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ptger1P35375 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ptger1P35375 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ptger1P35375 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ptger1P35375 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ptger1P35375 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ptger1P35375 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ptger1P35375 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ptger1P35375 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Ptger1P35375 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ptger1P35375 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ptger1P35375 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ptger1P35375 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ptger1P35375 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ptger1P35375 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Ptger1P35375 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ptger1P35375 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ptger1P35375 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ptger1P35375 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Ptger1P35375 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Ptger1P35375 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ptger1P35375 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Ptger1P35375 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ptger1P35375 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ptger1P35375 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ptger1P35375 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ptger1P35375 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ptger1P35375 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ptger1P35375 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ptger1P35375 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ptger1P35375 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ptger1P35375 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ptger1P35375 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms