Protein–RNA interactions for Protein: P35279

Rab6a, Ras-related protein Rab-6A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab6aP35279 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rab6aP35279 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rab6aP35279 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rab6aP35279 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rab6aP35279 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rab6aP35279 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rab6aP35279 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rab6aP35279 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rab6aP35279 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rab6aP35279 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rab6aP35279 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rab6aP35279 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rab6aP35279 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rab6aP35279 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rab6aP35279 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.2■□□□□ 0.99
Rab6aP35279 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rab6aP35279 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rab6aP35279 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rab6aP35279 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rab6aP35279 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rab6aP35279 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rab6aP35279 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rab6aP35279 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rab6aP35279 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rab6aP35279 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rab6aP35279 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rab6aP35279 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rab6aP35279 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Rab6aP35279 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rab6aP35279 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rab6aP35279 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rab6aP35279 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rab6aP35279 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rab6aP35279 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rab6aP35279 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rab6aP35279 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rab6aP35279 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rab6aP35279 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rab6aP35279 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rab6aP35279 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rab6aP35279 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rab6aP35279 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rab6aP35279 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rab6aP35279 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rab6aP35279 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rab6aP35279 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rab6aP35279 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rab6aP35279 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rab6aP35279 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rab6aP35279 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rab6aP35279 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Rab6aP35279 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Rab6aP35279 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rab6aP35279 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rab6aP35279 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rab6aP35279 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rab6aP35279 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rab6aP35279 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rab6aP35279 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rab6aP35279 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rab6aP35279 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rab6aP35279 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rab6aP35279 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rab6aP35279 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rab6aP35279 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rab6aP35279 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rab6aP35279 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Rab6aP35279 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rab6aP35279 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rab6aP35279 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rab6aP35279 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rab6aP35279 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rab6aP35279 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rab6aP35279 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rab6aP35279 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rab6aP35279 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rab6aP35279 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rab6aP35279 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rab6aP35279 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rab6aP35279 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rab6aP35279 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rab6aP35279 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rab6aP35279 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rab6aP35279 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rab6aP35279 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rab6aP35279 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rab6aP35279 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rab6aP35279 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rab6aP35279 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Rab6aP35279 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rab6aP35279 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rab6aP35279 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rab6aP35279 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rab6aP35279 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rab6aP35279 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Rab6aP35279 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rab6aP35279 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rab6aP35279 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rab6aP35279 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rab6aP35279 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms