Protein–RNA interactions for Protein: P30285

Cdk4, Cyclin-dependent kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk4P30285 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cdk4P30285 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cdk4P30285 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cdk4P30285 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cdk4P30285 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cdk4P30285 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cdk4P30285 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cdk4P30285 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cdk4P30285 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cdk4P30285 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cdk4P30285 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cdk4P30285 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cdk4P30285 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Cdk4P30285 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Cdk4P30285 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Cdk4P30285 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cdk4P30285 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cdk4P30285 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Cdk4P30285 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cdk4P30285 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cdk4P30285 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cdk4P30285 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cdk4P30285 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cdk4P30285 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Cdk4P30285 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cdk4P30285 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cdk4P30285 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Cdk4P30285 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cdk4P30285 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cdk4P30285 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cdk4P30285 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cdk4P30285 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Cdk4P30285 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cdk4P30285 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cdk4P30285 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cdk4P30285 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cdk4P30285 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cdk4P30285 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cdk4P30285 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cdk4P30285 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cdk4P30285 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cdk4P30285 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cdk4P30285 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cdk4P30285 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cdk4P30285 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cdk4P30285 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cdk4P30285 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cdk4P30285 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cdk4P30285 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Cdk4P30285 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cdk4P30285 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cdk4P30285 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cdk4P30285 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cdk4P30285 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cdk4P30285 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cdk4P30285 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cdk4P30285 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Cdk4P30285 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Cdk4P30285 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cdk4P30285 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cdk4P30285 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cdk4P30285 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cdk4P30285 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cdk4P30285 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cdk4P30285 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cdk4P30285 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cdk4P30285 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cdk4P30285 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cdk4P30285 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cdk4P30285 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cdk4P30285 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cdk4P30285 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cdk4P30285 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cdk4P30285 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cdk4P30285 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Cdk4P30285 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cdk4P30285 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cdk4P30285 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cdk4P30285 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cdk4P30285 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cdk4P30285 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cdk4P30285 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cdk4P30285 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cdk4P30285 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cdk4P30285 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cdk4P30285 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cdk4P30285 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cdk4P30285 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cdk4P30285 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cdk4P30285 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cdk4P30285 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cdk4P30285 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cdk4P30285 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cdk4P30285 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cdk4P30285 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cdk4P30285 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cdk4P30285 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cdk4P30285 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cdk4P30285 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cdk4P30285 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms