Protein–RNA interactions for Protein: P28738

Kif5c, Kinesin heavy chain isoform 5C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif5cP28738 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Kif5cP28738 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Kif5cP28738 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Kif5cP28738 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Kif5cP28738 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Kif5cP28738 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Kif5cP28738 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Kif5cP28738 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Kif5cP28738 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Kif5cP28738 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Kif5cP28738 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Kif5cP28738 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Kif5cP28738 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Kif5cP28738 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Kif5cP28738 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Kif5cP28738 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Kif5cP28738 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Kif5cP28738 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Kif5cP28738 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Kif5cP28738 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Kif5cP28738 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Kif5cP28738 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Kif5cP28738 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Kif5cP28738 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Kif5cP28738 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Kif5cP28738 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Kif5cP28738 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Kif5cP28738 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Kif5cP28738 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Kif5cP28738 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Kif5cP28738 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Kif5cP28738 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Kif5cP28738 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Kif5cP28738 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Kif5cP28738 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Kif5cP28738 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Kif5cP28738 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Kif5cP28738 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Kif5cP28738 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Kif5cP28738 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Kif5cP28738 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Kif5cP28738 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Kif5cP28738 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Kif5cP28738 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Kif5cP28738 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Kif5cP28738 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Kif5cP28738 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Kif5cP28738 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Kif5cP28738 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Kif5cP28738 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Kif5cP28738 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Kif5cP28738 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Kif5cP28738 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Kif5cP28738 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Kif5cP28738 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Kif5cP28738 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Kif5cP28738 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Kif5cP28738 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Kif5cP28738 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Kif5cP28738 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Kif5cP28738 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Kif5cP28738 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Kif5cP28738 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Kif5cP28738 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Kif5cP28738 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Kif5cP28738 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Kif5cP28738 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Kif5cP28738 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Kif5cP28738 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Kif5cP28738 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Kif5cP28738 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Kif5cP28738 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Kif5cP28738 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Kif5cP28738 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Kif5cP28738 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Kif5cP28738 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Kif5cP28738 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Kif5cP28738 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Kif5cP28738 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Kif5cP28738 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Kif5cP28738 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Kif5cP28738 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Kif5cP28738 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Kif5cP28738 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Kif5cP28738 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Kif5cP28738 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Kif5cP28738 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Kif5cP28738 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Kif5cP28738 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Kif5cP28738 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Kif5cP28738 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Kif5cP28738 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Kif5cP28738 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Kif5cP28738 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Kif5cP28738 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Kif5cP28738 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Kif5cP28738 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Kif5cP28738 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Kif5cP28738 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Kif5cP28738 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.2 ms