Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Gjb1P28230 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Gjb1P28230 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Gjb1P28230 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Gjb1P28230 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Gjb1P28230 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Gjb1P28230 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Gjb1P28230 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Gjb1P28230 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Gjb1P28230 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Gjb1P28230 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Gjb1P28230 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Gjb1P28230 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Gjb1P28230 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Gjb1P28230 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Gjb1P28230 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Gjb1P28230 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Gjb1P28230 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Gjb1P28230 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Gjb1P28230 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Gjb1P28230 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Gjb1P28230 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Gjb1P28230 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Gjb1P28230 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Gjb1P28230 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Gjb1P28230 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Gjb1P28230 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Gjb1P28230 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Gjb1P28230 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Gjb1P28230 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Gjb1P28230 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Gjb1P28230 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Gjb1P28230 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Gjb1P28230 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Gjb1P28230 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Gjb1P28230 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Gjb1P28230 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Gjb1P28230 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Gjb1P28230 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Gjb1P28230 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Gjb1P28230 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Gjb1P28230 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Gjb1P28230 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
Gjb1P28230 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Gjb1P28230 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Gjb1P28230 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Gjb1P28230 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Gjb1P28230 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Gjb1P28230 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Gjb1P28230 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Gjb1P28230 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Gjb1P28230 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Gjb1P28230 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Gjb1P28230 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Gjb1P28230 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Gjb1P28230 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Gjb1P28230 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Gjb1P28230 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Gjb1P28230 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Gjb1P28230 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Gjb1P28230 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Gjb1P28230 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Gjb1P28230 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Gjb1P28230 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Gjb1P28230 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Gjb1P28230 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Gjb1P28230 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Gjb1P28230 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Gjb1P28230 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Gjb1P28230 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Gjb1P28230 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Gjb1P28230 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Gjb1P28230 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Gjb1P28230 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Gjb1P28230 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Gjb1P28230 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Gjb1P28230 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Gjb1P28230 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Gjb1P28230 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Gjb1P28230 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Gjb1P28230 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Gjb1P28230 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Gjb1P28230 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Gjb1P28230 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Gjb1P28230 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Gjb1P28230 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Gjb1P28230 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Gjb1P28230 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Gjb1P28230 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Gjb1P28230 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Gjb1P28230 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Gjb1P28230 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Gjb1P28230 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Gjb1P28230 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Gjb1P28230 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Gjb1P28230 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Gjb1P28230 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Gjb1P28230 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Gjb1P28230 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Gjb1P28230 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms