Protein–RNA interactions for Protein: P27782

Lef1, Lymphoid enhancer-binding factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lef1P27782 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lef1P27782 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lef1P27782 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lef1P27782 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lef1P27782 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lef1P27782 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lef1P27782 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lef1P27782 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lef1P27782 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lef1P27782 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lef1P27782 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lef1P27782 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lef1P27782 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lef1P27782 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lef1P27782 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lef1P27782 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Lef1P27782 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Lef1P27782 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lef1P27782 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lef1P27782 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lef1P27782 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lef1P27782 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lef1P27782 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lef1P27782 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lef1P27782 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lef1P27782 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lef1P27782 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lef1P27782 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lef1P27782 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lef1P27782 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lef1P27782 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lef1P27782 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lef1P27782 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lef1P27782 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lef1P27782 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lef1P27782 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lef1P27782 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lef1P27782 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lef1P27782 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Lef1P27782 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lef1P27782 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lef1P27782 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lef1P27782 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lef1P27782 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lef1P27782 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lef1P27782 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Lef1P27782 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lef1P27782 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lef1P27782 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lef1P27782 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lef1P27782 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lef1P27782 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Lef1P27782 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lef1P27782 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lef1P27782 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lef1P27782 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lef1P27782 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lef1P27782 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lef1P27782 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lef1P27782 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lef1P27782 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lef1P27782 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lef1P27782 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Lef1P27782 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lef1P27782 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lef1P27782 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lef1P27782 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lef1P27782 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lef1P27782 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lef1P27782 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lef1P27782 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Lef1P27782 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lef1P27782 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lef1P27782 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lef1P27782 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lef1P27782 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lef1P27782 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lef1P27782 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lef1P27782 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lef1P27782 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lef1P27782 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lef1P27782 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lef1P27782 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lef1P27782 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lef1P27782 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lef1P27782 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lef1P27782 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lef1P27782 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lef1P27782 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lef1P27782 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lef1P27782 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Lef1P27782 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Lef1P27782 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lef1P27782 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lef1P27782 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lef1P27782 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lef1P27782 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Lef1P27782 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lef1P27782 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lef1P27782 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.2 ms