Protein–RNA interactions for Protein: P23906

Irf2, Interferon regulatory factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf2P23906 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Irf2P23906 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Irf2P23906 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Irf2P23906 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Irf2P23906 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Irf2P23906 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Irf2P23906 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Irf2P23906 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Irf2P23906 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Irf2P23906 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Irf2P23906 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Irf2P23906 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Irf2P23906 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Irf2P23906 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Irf2P23906 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Irf2P23906 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Irf2P23906 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Irf2P23906 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Irf2P23906 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Irf2P23906 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Irf2P23906 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Irf2P23906 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Irf2P23906 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Irf2P23906 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Irf2P23906 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Irf2P23906 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Irf2P23906 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Irf2P23906 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Irf2P23906 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Irf2P23906 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Irf2P23906 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Irf2P23906 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Irf2P23906 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Irf2P23906 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Irf2P23906 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Irf2P23906 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Irf2P23906 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Irf2P23906 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Irf2P23906 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Irf2P23906 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Irf2P23906 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Irf2P23906 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Irf2P23906 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Irf2P23906 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Irf2P23906 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Irf2P23906 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Irf2P23906 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Irf2P23906 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Irf2P23906 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Irf2P23906 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Irf2P23906 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Irf2P23906 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Irf2P23906 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Irf2P23906 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Irf2P23906 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Irf2P23906 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Irf2P23906 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Irf2P23906 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Irf2P23906 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Irf2P23906 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Irf2P23906 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Irf2P23906 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Irf2P23906 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Irf2P23906 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Irf2P23906 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Irf2P23906 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Irf2P23906 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Irf2P23906 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Irf2P23906 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Irf2P23906 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Irf2P23906 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Irf2P23906 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
Irf2P23906 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Irf2P23906 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Irf2P23906 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Irf2P23906 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Irf2P23906 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Irf2P23906 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Irf2P23906 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Irf2P23906 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Irf2P23906 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Irf2P23906 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Irf2P23906 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Irf2P23906 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Irf2P23906 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Irf2P23906 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Irf2P23906 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Irf2P23906 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Irf2P23906 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Irf2P23906 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Irf2P23906 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Irf2P23906 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Irf2P23906 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Irf2P23906 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Irf2P23906 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Irf2P23906 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Irf2P23906 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Irf2P23906 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Irf2P23906 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Irf2P23906 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.7 ms