Protein–RNA interactions for Protein: P23607

Zfa, Zinc finger autosomal protein, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZfaP23607 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZfaP23607 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZfaP23607 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZfaP23607 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
ZfaP23607 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZfaP23607 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZfaP23607 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZfaP23607 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZfaP23607 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZfaP23607 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZfaP23607 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZfaP23607 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZfaP23607 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZfaP23607 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZfaP23607 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
ZfaP23607 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZfaP23607 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZfaP23607 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZfaP23607 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZfaP23607 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZfaP23607 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZfaP23607 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZfaP23607 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZfaP23607 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ZfaP23607 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZfaP23607 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZfaP23607 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZfaP23607 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ZfaP23607 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZfaP23607 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZfaP23607 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZfaP23607 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZfaP23607 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZfaP23607 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
ZfaP23607 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZfaP23607 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
ZfaP23607 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ZfaP23607 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZfaP23607 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZfaP23607 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZfaP23607 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZfaP23607 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZfaP23607 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ZfaP23607 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZfaP23607 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZfaP23607 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZfaP23607 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZfaP23607 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZfaP23607 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZfaP23607 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZfaP23607 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZfaP23607 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZfaP23607 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZfaP23607 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZfaP23607 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
ZfaP23607 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZfaP23607 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZfaP23607 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZfaP23607 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZfaP23607 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZfaP23607 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZfaP23607 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZfaP23607 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZfaP23607 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZfaP23607 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZfaP23607 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZfaP23607 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ZfaP23607 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZfaP23607 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZfaP23607 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZfaP23607 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ZfaP23607 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ZfaP23607 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZfaP23607 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZfaP23607 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZfaP23607 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZfaP23607 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZfaP23607 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZfaP23607 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZfaP23607 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZfaP23607 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZfaP23607 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZfaP23607 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZfaP23607 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZfaP23607 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZfaP23607 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZfaP23607 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZfaP23607 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZfaP23607 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZfaP23607 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZfaP23607 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZfaP23607 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZfaP23607 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZfaP23607 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZfaP23607 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZfaP23607 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZfaP23607 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZfaP23607 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZfaP23607 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZfaP23607 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms