Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PrkchP23298 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PrkchP23298 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PrkchP23298 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PrkchP23298 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PrkchP23298 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PrkchP23298 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PrkchP23298 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PrkchP23298 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PrkchP23298 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PrkchP23298 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PrkchP23298 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PrkchP23298 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PrkchP23298 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PrkchP23298 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PrkchP23298 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PrkchP23298 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PrkchP23298 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PrkchP23298 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PrkchP23298 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PrkchP23298 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PrkchP23298 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PrkchP23298 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PrkchP23298 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PrkchP23298 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PrkchP23298 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PrkchP23298 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PrkchP23298 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PrkchP23298 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PrkchP23298 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PrkchP23298 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PrkchP23298 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PrkchP23298 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PrkchP23298 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PrkchP23298 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PrkchP23298 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PrkchP23298 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PrkchP23298 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PrkchP23298 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PrkchP23298 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PrkchP23298 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PrkchP23298 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PrkchP23298 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PrkchP23298 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PrkchP23298 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PrkchP23298 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PrkchP23298 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PrkchP23298 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PrkchP23298 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PrkchP23298 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PrkchP23298 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PrkchP23298 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PrkchP23298 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PrkchP23298 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PrkchP23298 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PrkchP23298 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PrkchP23298 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PrkchP23298 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PrkchP23298 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PrkchP23298 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PrkchP23298 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PrkchP23298 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PrkchP23298 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PrkchP23298 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PrkchP23298 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PrkchP23298 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PrkchP23298 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PrkchP23298 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PrkchP23298 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PrkchP23298 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PrkchP23298 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PrkchP23298 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PrkchP23298 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PrkchP23298 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PrkchP23298 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PrkchP23298 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PrkchP23298 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PrkchP23298 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PrkchP23298 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PrkchP23298 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PrkchP23298 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PrkchP23298 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PrkchP23298 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PrkchP23298 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PrkchP23298 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PrkchP23298 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PrkchP23298 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PrkchP23298 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PrkchP23298 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PrkchP23298 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PrkchP23298 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PrkchP23298 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
PrkchP23298 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PrkchP23298 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PrkchP23298 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PrkchP23298 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PrkchP23298 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PrkchP23298 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PrkchP23298 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PrkchP23298 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms