Protein–RNA interactions for Protein: P21995

Emb, Embigin, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EmbP21995 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
EmbP21995 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
EmbP21995 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
EmbP21995 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
EmbP21995 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
EmbP21995 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
EmbP21995 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
EmbP21995 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
EmbP21995 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
EmbP21995 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
EmbP21995 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
EmbP21995 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
EmbP21995 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
EmbP21995 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
EmbP21995 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
EmbP21995 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
EmbP21995 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
EmbP21995 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
EmbP21995 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
EmbP21995 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
EmbP21995 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
EmbP21995 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
EmbP21995 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
EmbP21995 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
EmbP21995 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
EmbP21995 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
EmbP21995 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
EmbP21995 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
EmbP21995 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
EmbP21995 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
EmbP21995 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
EmbP21995 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
EmbP21995 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
EmbP21995 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
EmbP21995 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
EmbP21995 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
EmbP21995 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
EmbP21995 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
EmbP21995 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
EmbP21995 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
EmbP21995 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
EmbP21995 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
EmbP21995 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EmbP21995 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
EmbP21995 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
EmbP21995 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
EmbP21995 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EmbP21995 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EmbP21995 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
EmbP21995 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
EmbP21995 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
EmbP21995 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
EmbP21995 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
EmbP21995 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
EmbP21995 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
EmbP21995 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
EmbP21995 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
EmbP21995 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
EmbP21995 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
EmbP21995 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
EmbP21995 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
EmbP21995 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
EmbP21995 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
EmbP21995 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
EmbP21995 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
EmbP21995 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
EmbP21995 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
EmbP21995 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
EmbP21995 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
EmbP21995 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
EmbP21995 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
EmbP21995 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
EmbP21995 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
EmbP21995 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
EmbP21995 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
EmbP21995 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
EmbP21995 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
EmbP21995 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
EmbP21995 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
EmbP21995 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
EmbP21995 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
EmbP21995 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
EmbP21995 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
EmbP21995 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
EmbP21995 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
EmbP21995 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
EmbP21995 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
EmbP21995 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
EmbP21995 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
EmbP21995 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
EmbP21995 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
EmbP21995 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
EmbP21995 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
EmbP21995 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
EmbP21995 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
EmbP21995 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
EmbP21995 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
EmbP21995 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
EmbP21995 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
EmbP21995 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms