Protein–RNA interactions for Protein: P19228

Csn1s1, Alpha-S1-casein, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csn1s1P19228 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Csn1s1P19228 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Csn1s1P19228 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Csn1s1P19228 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Csn1s1P19228 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Csn1s1P19228 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Csn1s1P19228 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Csn1s1P19228 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Csn1s1P19228 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Csn1s1P19228 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Csn1s1P19228 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Csn1s1P19228 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Csn1s1P19228 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Csn1s1P19228 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Csn1s1P19228 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Csn1s1P19228 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Csn1s1P19228 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Csn1s1P19228 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Csn1s1P19228 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Csn1s1P19228 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Csn1s1P19228 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Csn1s1P19228 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Csn1s1P19228 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Csn1s1P19228 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Csn1s1P19228 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Csn1s1P19228 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Csn1s1P19228 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Csn1s1P19228 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Csn1s1P19228 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Csn1s1P19228 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Csn1s1P19228 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Csn1s1P19228 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Csn1s1P19228 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Csn1s1P19228 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Csn1s1P19228 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Csn1s1P19228 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Csn1s1P19228 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Csn1s1P19228 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Csn1s1P19228 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Csn1s1P19228 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Csn1s1P19228 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Csn1s1P19228 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Csn1s1P19228 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Csn1s1P19228 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Csn1s1P19228 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Csn1s1P19228 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Csn1s1P19228 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Csn1s1P19228 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Csn1s1P19228 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Csn1s1P19228 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Csn1s1P19228 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Csn1s1P19228 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Csn1s1P19228 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Csn1s1P19228 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Csn1s1P19228 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Csn1s1P19228 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Csn1s1P19228 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Csn1s1P19228 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Csn1s1P19228 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Csn1s1P19228 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Csn1s1P19228 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Csn1s1P19228 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Csn1s1P19228 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Csn1s1P19228 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Csn1s1P19228 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Csn1s1P19228 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Csn1s1P19228 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Csn1s1P19228 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Csn1s1P19228 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Csn1s1P19228 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Csn1s1P19228 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Csn1s1P19228 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Csn1s1P19228 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Csn1s1P19228 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Csn1s1P19228 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Csn1s1P19228 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Csn1s1P19228 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Csn1s1P19228 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Csn1s1P19228 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Csn1s1P19228 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Csn1s1P19228 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Csn1s1P19228 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Csn1s1P19228 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Csn1s1P19228 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Csn1s1P19228 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Csn1s1P19228 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Csn1s1P19228 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Csn1s1P19228 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Csn1s1P19228 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Csn1s1P19228 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Csn1s1P19228 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Csn1s1P19228 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Csn1s1P19228 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Csn1s1P19228 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Csn1s1P19228 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Csn1s1P19228 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Csn1s1P19228 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Csn1s1P19228 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Csn1s1P19228 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Csn1s1P19228 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.4 ms