Protein–RNA interactions for Protein: P18528

Ig heavy chain V region 6.96, mousemouse

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Length 98 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18528 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
P18528 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
P18528 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
P18528 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
P18528 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
P18528 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
P18528 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
P18528 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
P18528 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
P18528 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
P18528 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
P18528 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
P18528 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
P18528 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
P18528 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
P18528 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
P18528 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
P18528 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
P18528 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
P18528 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
P18528 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
P18528 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
P18528 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
P18528 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
P18528 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
P18528 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
P18528 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
P18528 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
P18528 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
P18528 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
P18528 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
P18528 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
P18528 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
P18528 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
P18528 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
P18528 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
P18528 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
P18528 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
P18528 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
P18528 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
P18528 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
P18528 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
P18528 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
P18528 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
P18528 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
P18528 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
P18528 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
P18528 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
P18528 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
P18528 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
P18528 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
P18528 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
P18528 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
P18528 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
P18528 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
P18528 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
P18528 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
P18528 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
P18528 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
P18528 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
P18528 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
P18528 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
P18528 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
P18528 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
P18528 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
P18528 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
P18528 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
P18528 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
P18528 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
P18528 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
P18528 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
P18528 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
P18528 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
P18528 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
P18528 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
P18528 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
P18528 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
P18528 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
P18528 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
P18528 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
P18528 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
P18528 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
P18528 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
P18528 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
P18528 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
P18528 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
P18528 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
P18528 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
P18528 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
P18528 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
P18528 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
P18528 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
P18528 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
P18528 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
P18528 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
P18528 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
P18528 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
P18528 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
P18528 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
P18528 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms