Protein–RNA interactions for Protein: P15314

Irf1, Interferon regulatory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf1P15314 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Irf1P15314 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Irf1P15314 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Irf1P15314 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Irf1P15314 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Irf1P15314 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Irf1P15314 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Irf1P15314 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Irf1P15314 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Irf1P15314 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Irf1P15314 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Irf1P15314 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Irf1P15314 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Irf1P15314 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Irf1P15314 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Irf1P15314 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Irf1P15314 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Irf1P15314 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Irf1P15314 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Irf1P15314 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Irf1P15314 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Irf1P15314 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Irf1P15314 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Irf1P15314 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Irf1P15314 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Irf1P15314 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Irf1P15314 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Irf1P15314 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Irf1P15314 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Irf1P15314 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Irf1P15314 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Irf1P15314 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Irf1P15314 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Irf1P15314 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Irf1P15314 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Irf1P15314 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Irf1P15314 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Irf1P15314 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Irf1P15314 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Irf1P15314 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Irf1P15314 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Irf1P15314 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Irf1P15314 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Irf1P15314 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Irf1P15314 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Irf1P15314 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Irf1P15314 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Irf1P15314 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Irf1P15314 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Irf1P15314 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Irf1P15314 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Irf1P15314 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Irf1P15314 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Irf1P15314 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Irf1P15314 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Irf1P15314 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Irf1P15314 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Irf1P15314 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Irf1P15314 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Irf1P15314 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Irf1P15314 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Irf1P15314 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Irf1P15314 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Irf1P15314 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Irf1P15314 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Irf1P15314 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Irf1P15314 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Irf1P15314 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Irf1P15314 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Irf1P15314 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Irf1P15314 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Irf1P15314 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Irf1P15314 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Irf1P15314 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Irf1P15314 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Irf1P15314 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Irf1P15314 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Irf1P15314 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Irf1P15314 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Irf1P15314 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Irf1P15314 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Irf1P15314 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Irf1P15314 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Irf1P15314 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Irf1P15314 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Irf1P15314 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Irf1P15314 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Irf1P15314 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Irf1P15314 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Irf1P15314 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Irf1P15314 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Irf1P15314 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Irf1P15314 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Irf1P15314 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Irf1P15314 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Irf1P15314 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Irf1P15314 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Irf1P15314 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Irf1P15314 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Irf1P15314 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms