Protein–RNA interactions for Protein: P14220

Gypa, Glycophorin-A, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GypaP14220 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GypaP14220 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GypaP14220 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GypaP14220 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GypaP14220 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GypaP14220 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GypaP14220 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GypaP14220 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GypaP14220 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GypaP14220 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GypaP14220 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GypaP14220 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GypaP14220 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
GypaP14220 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GypaP14220 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GypaP14220 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GypaP14220 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GypaP14220 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GypaP14220 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GypaP14220 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GypaP14220 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GypaP14220 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GypaP14220 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GypaP14220 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GypaP14220 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GypaP14220 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GypaP14220 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GypaP14220 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GypaP14220 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GypaP14220 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GypaP14220 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GypaP14220 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GypaP14220 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GypaP14220 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GypaP14220 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GypaP14220 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GypaP14220 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GypaP14220 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GypaP14220 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GypaP14220 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GypaP14220 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GypaP14220 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
GypaP14220 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GypaP14220 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GypaP14220 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GypaP14220 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GypaP14220 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GypaP14220 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GypaP14220 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GypaP14220 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GypaP14220 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GypaP14220 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GypaP14220 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GypaP14220 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GypaP14220 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GypaP14220 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GypaP14220 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GypaP14220 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GypaP14220 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GypaP14220 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GypaP14220 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GypaP14220 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GypaP14220 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GypaP14220 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GypaP14220 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GypaP14220 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
GypaP14220 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GypaP14220 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GypaP14220 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GypaP14220 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GypaP14220 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GypaP14220 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GypaP14220 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GypaP14220 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GypaP14220 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GypaP14220 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GypaP14220 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GypaP14220 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GypaP14220 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GypaP14220 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GypaP14220 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GypaP14220 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GypaP14220 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GypaP14220 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GypaP14220 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GypaP14220 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GypaP14220 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GypaP14220 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GypaP14220 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GypaP14220 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GypaP14220 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GypaP14220 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GypaP14220 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GypaP14220 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GypaP14220 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GypaP14220 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GypaP14220 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GypaP14220 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GypaP14220 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GypaP14220 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms