Protein–RNA interactions for Protein: P13504

Il1r1, Interleukin-1 receptor type 1, mousemouse

Predictions only

Length 576 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Il1r1P13504 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Il1r1P13504 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Il1r1P13504 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Il1r1P13504 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Il1r1P13504 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Il1r1P13504 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Il1r1P13504 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Il1r1P13504 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Il1r1P13504 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Il1r1P13504 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Il1r1P13504 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Il1r1P13504 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Il1r1P13504 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Il1r1P13504 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Il1r1P13504 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Il1r1P13504 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Il1r1P13504 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Il1r1P13504 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Il1r1P13504 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Il1r1P13504 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Il1r1P13504 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Il1r1P13504 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Il1r1P13504 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Il1r1P13504 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Il1r1P13504 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Il1r1P13504 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Il1r1P13504 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Il1r1P13504 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Il1r1P13504 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Il1r1P13504 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Il1r1P13504 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Il1r1P13504 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Il1r1P13504 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Il1r1P13504 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Il1r1P13504 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Il1r1P13504 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Il1r1P13504 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Il1r1P13504 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Il1r1P13504 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Il1r1P13504 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Il1r1P13504 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Il1r1P13504 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Il1r1P13504 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Il1r1P13504 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Il1r1P13504 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Il1r1P13504 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Il1r1P13504 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Il1r1P13504 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Il1r1P13504 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Il1r1P13504 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Il1r1P13504 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Il1r1P13504 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Il1r1P13504 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Il1r1P13504 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Il1r1P13504 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Il1r1P13504 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Il1r1P13504 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Il1r1P13504 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Il1r1P13504 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Il1r1P13504 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Il1r1P13504 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Il1r1P13504 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Il1r1P13504 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Il1r1P13504 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Il1r1P13504 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Il1r1P13504 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Il1r1P13504 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Il1r1P13504 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Il1r1P13504 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Il1r1P13504 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Il1r1P13504 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Il1r1P13504 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Il1r1P13504 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Il1r1P13504 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Il1r1P13504 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Il1r1P13504 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Il1r1P13504 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Il1r1P13504 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Il1r1P13504 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Il1r1P13504 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Il1r1P13504 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Il1r1P13504 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Il1r1P13504 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Il1r1P13504 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Il1r1P13504 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Il1r1P13504 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Il1r1P13504 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Il1r1P13504 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Il1r1P13504 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Il1r1P13504 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Il1r1P13504 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Il1r1P13504 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Il1r1P13504 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Il1r1P13504 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Il1r1P13504 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Il1r1P13504 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Il1r1P13504 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Il1r1P13504 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Il1r1P13504 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Il1r1P13504 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms