Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vpreb1P13372 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vpreb1P13372 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vpreb1P13372 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vpreb1P13372 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vpreb1P13372 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vpreb1P13372 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vpreb1P13372 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vpreb1P13372 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vpreb1P13372 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vpreb1P13372 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Vpreb1P13372 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vpreb1P13372 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Vpreb1P13372 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vpreb1P13372 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Vpreb1P13372 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vpreb1P13372 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Vpreb1P13372 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vpreb1P13372 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vpreb1P13372 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vpreb1P13372 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vpreb1P13372 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vpreb1P13372 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vpreb1P13372 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vpreb1P13372 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vpreb1P13372 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vpreb1P13372 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vpreb1P13372 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vpreb1P13372 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vpreb1P13372 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vpreb1P13372 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vpreb1P13372 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vpreb1P13372 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vpreb1P13372 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vpreb1P13372 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vpreb1P13372 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vpreb1P13372 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vpreb1P13372 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vpreb1P13372 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vpreb1P13372 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vpreb1P13372 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Vpreb1P13372 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Vpreb1P13372 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vpreb1P13372 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vpreb1P13372 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vpreb1P13372 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vpreb1P13372 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vpreb1P13372 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vpreb1P13372 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vpreb1P13372 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vpreb1P13372 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vpreb1P13372 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vpreb1P13372 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vpreb1P13372 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vpreb1P13372 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vpreb1P13372 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vpreb1P13372 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vpreb1P13372 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vpreb1P13372 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vpreb1P13372 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vpreb1P13372 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vpreb1P13372 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Vpreb1P13372 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vpreb1P13372 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Vpreb1P13372 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vpreb1P13372 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vpreb1P13372 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vpreb1P13372 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vpreb1P13372 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Vpreb1P13372 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vpreb1P13372 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vpreb1P13372 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vpreb1P13372 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vpreb1P13372 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vpreb1P13372 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vpreb1P13372 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vpreb1P13372 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vpreb1P13372 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vpreb1P13372 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vpreb1P13372 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vpreb1P13372 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vpreb1P13372 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vpreb1P13372 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vpreb1P13372 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vpreb1P13372 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vpreb1P13372 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vpreb1P13372 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vpreb1P13372 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vpreb1P13372 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vpreb1P13372 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vpreb1P13372 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vpreb1P13372 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vpreb1P13372 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vpreb1P13372 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vpreb1P13372 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vpreb1P13372 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vpreb1P13372 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vpreb1P13372 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vpreb1P13372 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vpreb1P13372 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms