Protein–RNA interactions for Protein: P12813

Nr4a1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a1P12813 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nr4a1P12813 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nr4a1P12813 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nr4a1P12813 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nr4a1P12813 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Nr4a1P12813 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nr4a1P12813 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nr4a1P12813 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nr4a1P12813 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Nr4a1P12813 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nr4a1P12813 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nr4a1P12813 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nr4a1P12813 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nr4a1P12813 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nr4a1P12813 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nr4a1P12813 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nr4a1P12813 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nr4a1P12813 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nr4a1P12813 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nr4a1P12813 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nr4a1P12813 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nr4a1P12813 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nr4a1P12813 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nr4a1P12813 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nr4a1P12813 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nr4a1P12813 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nr4a1P12813 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nr4a1P12813 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nr4a1P12813 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nr4a1P12813 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nr4a1P12813 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nr4a1P12813 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nr4a1P12813 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nr4a1P12813 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nr4a1P12813 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nr4a1P12813 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nr4a1P12813 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nr4a1P12813 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nr4a1P12813 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Nr4a1P12813 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nr4a1P12813 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nr4a1P12813 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nr4a1P12813 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nr4a1P12813 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Nr4a1P12813 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Nr4a1P12813 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nr4a1P12813 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nr4a1P12813 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nr4a1P12813 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nr4a1P12813 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Nr4a1P12813 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nr4a1P12813 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nr4a1P12813 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nr4a1P12813 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nr4a1P12813 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nr4a1P12813 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nr4a1P12813 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nr4a1P12813 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nr4a1P12813 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nr4a1P12813 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nr4a1P12813 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nr4a1P12813 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nr4a1P12813 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nr4a1P12813 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nr4a1P12813 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nr4a1P12813 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nr4a1P12813 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nr4a1P12813 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nr4a1P12813 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nr4a1P12813 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Nr4a1P12813 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nr4a1P12813 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nr4a1P12813 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nr4a1P12813 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nr4a1P12813 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nr4a1P12813 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nr4a1P12813 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nr4a1P12813 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nr4a1P12813 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nr4a1P12813 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Nr4a1P12813 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nr4a1P12813 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nr4a1P12813 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nr4a1P12813 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nr4a1P12813 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nr4a1P12813 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nr4a1P12813 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nr4a1P12813 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nr4a1P12813 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nr4a1P12813 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Nr4a1P12813 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nr4a1P12813 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Nr4a1P12813 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nr4a1P12813 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nr4a1P12813 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nr4a1P12813 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nr4a1P12813 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nr4a1P12813 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nr4a1P12813 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nr4a1P12813 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms