Protein–RNA interactions for Protein: P12399

Ctla2a, Protein CTLA-2-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctla2aP12399 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ctla2aP12399 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ctla2aP12399 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ctla2aP12399 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ctla2aP12399 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ctla2aP12399 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ctla2aP12399 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ctla2aP12399 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ctla2aP12399 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ctla2aP12399 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ctla2aP12399 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ctla2aP12399 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ctla2aP12399 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ctla2aP12399 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ctla2aP12399 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ctla2aP12399 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ctla2aP12399 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ctla2aP12399 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ctla2aP12399 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ctla2aP12399 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ctla2aP12399 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ctla2aP12399 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ctla2aP12399 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ctla2aP12399 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ctla2aP12399 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ctla2aP12399 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ctla2aP12399 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ctla2aP12399 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ctla2aP12399 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ctla2aP12399 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ctla2aP12399 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ctla2aP12399 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ctla2aP12399 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ctla2aP12399 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ctla2aP12399 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ctla2aP12399 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ctla2aP12399 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ctla2aP12399 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ctla2aP12399 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ctla2aP12399 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ctla2aP12399 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ctla2aP12399 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ctla2aP12399 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ctla2aP12399 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ctla2aP12399 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ctla2aP12399 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ctla2aP12399 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ctla2aP12399 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ctla2aP12399 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ctla2aP12399 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ctla2aP12399 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ctla2aP12399 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ctla2aP12399 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ctla2aP12399 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ctla2aP12399 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ctla2aP12399 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ctla2aP12399 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ctla2aP12399 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ctla2aP12399 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ctla2aP12399 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ctla2aP12399 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ctla2aP12399 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ctla2aP12399 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Ctla2aP12399 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ctla2aP12399 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ctla2aP12399 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ctla2aP12399 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ctla2aP12399 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ctla2aP12399 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ctla2aP12399 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ctla2aP12399 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ctla2aP12399 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ctla2aP12399 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ctla2aP12399 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ctla2aP12399 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ctla2aP12399 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ctla2aP12399 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ctla2aP12399 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ctla2aP12399 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Ctla2aP12399 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ctla2aP12399 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ctla2aP12399 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ctla2aP12399 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ctla2aP12399 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ctla2aP12399 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ctla2aP12399 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ctla2aP12399 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ctla2aP12399 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ctla2aP12399 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ctla2aP12399 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ctla2aP12399 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ctla2aP12399 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ctla2aP12399 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ctla2aP12399 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ctla2aP12399 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ctla2aP12399 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ctla2aP12399 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ctla2aP12399 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ctla2aP12399 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ctla2aP12399 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms