Protein–RNA interactions for Protein: P11688

Itga5, Integrin alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga5P11688 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Itga5P11688 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Itga5P11688 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Itga5P11688 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Itga5P11688 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Itga5P11688 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Itga5P11688 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Itga5P11688 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Itga5P11688 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Itga5P11688 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Itga5P11688 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Itga5P11688 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Itga5P11688 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Itga5P11688 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Itga5P11688 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Itga5P11688 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Itga5P11688 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Itga5P11688 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Itga5P11688 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Itga5P11688 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Itga5P11688 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Itga5P11688 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Itga5P11688 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Itga5P11688 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Itga5P11688 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Itga5P11688 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Itga5P11688 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Itga5P11688 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Itga5P11688 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Itga5P11688 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Itga5P11688 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Itga5P11688 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Itga5P11688 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Itga5P11688 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Itga5P11688 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Itga5P11688 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Itga5P11688 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Itga5P11688 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Itga5P11688 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Itga5P11688 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Itga5P11688 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Itga5P11688 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Itga5P11688 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Itga5P11688 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Itga5P11688 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Itga5P11688 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Itga5P11688 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Itga5P11688 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Itga5P11688 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Itga5P11688 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Itga5P11688 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Itga5P11688 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Itga5P11688 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Itga5P11688 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Itga5P11688 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Itga5P11688 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Itga5P11688 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Itga5P11688 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Itga5P11688 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Itga5P11688 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Itga5P11688 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Itga5P11688 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Itga5P11688 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Itga5P11688 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Itga5P11688 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Itga5P11688 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Itga5P11688 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Itga5P11688 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Itga5P11688 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Itga5P11688 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Itga5P11688 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Itga5P11688 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Itga5P11688 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Itga5P11688 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Itga5P11688 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Itga5P11688 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Itga5P11688 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Itga5P11688 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Itga5P11688 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Itga5P11688 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Itga5P11688 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Itga5P11688 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Itga5P11688 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Itga5P11688 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Itga5P11688 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Itga5P11688 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Itga5P11688 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Itga5P11688 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Itga5P11688 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Itga5P11688 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Itga5P11688 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Itga5P11688 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Itga5P11688 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Itga5P11688 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Itga5P11688 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Itga5P11688 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Itga5P11688 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Itga5P11688 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Itga5P11688 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Itga5P11688 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 267.3 ms