Protein–RNA interactions for Protein: P11679

Krt8, Keratin, type II cytoskeletal 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt8P11679 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Krt8P11679 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Krt8P11679 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Krt8P11679 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Krt8P11679 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Krt8P11679 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Krt8P11679 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Krt8P11679 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Krt8P11679 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Krt8P11679 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Krt8P11679 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Krt8P11679 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Krt8P11679 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Krt8P11679 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Krt8P11679 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Krt8P11679 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Krt8P11679 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Krt8P11679 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Krt8P11679 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Krt8P11679 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Krt8P11679 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Krt8P11679 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Krt8P11679 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Krt8P11679 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Krt8P11679 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Krt8P11679 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Krt8P11679 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Krt8P11679 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Krt8P11679 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Krt8P11679 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Krt8P11679 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Krt8P11679 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Krt8P11679 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Krt8P11679 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Krt8P11679 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Krt8P11679 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Krt8P11679 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Krt8P11679 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Krt8P11679 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Krt8P11679 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Krt8P11679 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Krt8P11679 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Krt8P11679 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Krt8P11679 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Krt8P11679 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Krt8P11679 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Krt8P11679 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Krt8P11679 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Krt8P11679 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Krt8P11679 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Krt8P11679 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Krt8P11679 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Krt8P11679 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Krt8P11679 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Krt8P11679 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Krt8P11679 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Krt8P11679 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Krt8P11679 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Krt8P11679 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Krt8P11679 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Krt8P11679 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Krt8P11679 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Krt8P11679 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Krt8P11679 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Krt8P11679 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Krt8P11679 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Krt8P11679 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Krt8P11679 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Krt8P11679 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Krt8P11679 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Krt8P11679 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Krt8P11679 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Krt8P11679 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Krt8P11679 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Krt8P11679 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Krt8P11679 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Krt8P11679 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Krt8P11679 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Krt8P11679 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Krt8P11679 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Krt8P11679 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Krt8P11679 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Krt8P11679 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Krt8P11679 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Krt8P11679 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Krt8P11679 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Krt8P11679 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Krt8P11679 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Krt8P11679 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Krt8P11679 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Krt8P11679 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Krt8P11679 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Krt8P11679 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Krt8P11679 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Krt8P11679 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Krt8P11679 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Krt8P11679 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Krt8P11679 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Krt8P11679 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Krt8P11679 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms