Protein–RNA interactions for Protein: P11152

Lpl, Lipoprotein lipase, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LplP11152 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LplP11152 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LplP11152 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LplP11152 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LplP11152 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LplP11152 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LplP11152 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LplP11152 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LplP11152 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LplP11152 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
LplP11152 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LplP11152 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LplP11152 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
LplP11152 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LplP11152 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LplP11152 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LplP11152 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LplP11152 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LplP11152 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LplP11152 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LplP11152 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LplP11152 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LplP11152 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LplP11152 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LplP11152 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LplP11152 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LplP11152 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LplP11152 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LplP11152 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LplP11152 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LplP11152 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LplP11152 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LplP11152 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LplP11152 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LplP11152 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LplP11152 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LplP11152 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LplP11152 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LplP11152 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LplP11152 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LplP11152 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LplP11152 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LplP11152 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LplP11152 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LplP11152 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LplP11152 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.27■■□□□ 1
LplP11152 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LplP11152 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LplP11152 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LplP11152 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LplP11152 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LplP11152 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
LplP11152 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LplP11152 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LplP11152 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LplP11152 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LplP11152 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LplP11152 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
LplP11152 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LplP11152 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LplP11152 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LplP11152 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
LplP11152 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LplP11152 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LplP11152 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LplP11152 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LplP11152 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LplP11152 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LplP11152 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LplP11152 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LplP11152 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LplP11152 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LplP11152 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LplP11152 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LplP11152 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LplP11152 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LplP11152 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LplP11152 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LplP11152 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LplP11152 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LplP11152 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
LplP11152 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
LplP11152 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LplP11152 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LplP11152 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LplP11152 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LplP11152 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LplP11152 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LplP11152 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LplP11152 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LplP11152 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LplP11152 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LplP11152 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LplP11152 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
LplP11152 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LplP11152 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LplP11152 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LplP11152 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LplP11152 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LplP11152 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms