Protein–RNA interactions for Protein: P11031

Sub1, Activated RNA polymerase II transcriptional coactivator p15, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sub1P11031 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sub1P11031 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sub1P11031 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sub1P11031 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sub1P11031 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sub1P11031 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sub1P11031 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sub1P11031 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sub1P11031 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sub1P11031 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sub1P11031 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sub1P11031 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sub1P11031 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sub1P11031 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sub1P11031 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sub1P11031 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sub1P11031 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sub1P11031 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sub1P11031 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sub1P11031 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sub1P11031 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Sub1P11031 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sub1P11031 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sub1P11031 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sub1P11031 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sub1P11031 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sub1P11031 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sub1P11031 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sub1P11031 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sub1P11031 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sub1P11031 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sub1P11031 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sub1P11031 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sub1P11031 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sub1P11031 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sub1P11031 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sub1P11031 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sub1P11031 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Sub1P11031 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sub1P11031 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sub1P11031 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sub1P11031 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sub1P11031 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sub1P11031 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sub1P11031 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sub1P11031 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sub1P11031 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sub1P11031 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sub1P11031 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sub1P11031 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sub1P11031 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sub1P11031 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sub1P11031 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sub1P11031 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sub1P11031 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sub1P11031 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sub1P11031 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sub1P11031 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sub1P11031 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sub1P11031 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sub1P11031 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sub1P11031 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sub1P11031 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sub1P11031 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sub1P11031 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sub1P11031 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sub1P11031 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sub1P11031 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sub1P11031 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sub1P11031 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sub1P11031 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sub1P11031 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sub1P11031 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sub1P11031 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sub1P11031 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sub1P11031 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sub1P11031 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sub1P11031 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sub1P11031 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sub1P11031 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sub1P11031 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sub1P11031 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sub1P11031 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sub1P11031 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sub1P11031 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sub1P11031 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sub1P11031 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sub1P11031 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sub1P11031 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sub1P11031 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sub1P11031 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sub1P11031 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sub1P11031 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sub1P11031 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sub1P11031 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sub1P11031 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sub1P11031 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sub1P11031 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sub1P11031 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sub1P11031 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms