Protein–RNA interactions for Protein: P10711

Tcea1, Transcription elongation factor A protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcea1P10711 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tcea1P10711 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tcea1P10711 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tcea1P10711 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tcea1P10711 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tcea1P10711 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tcea1P10711 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Tcea1P10711 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tcea1P10711 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tcea1P10711 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tcea1P10711 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tcea1P10711 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tcea1P10711 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tcea1P10711 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tcea1P10711 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tcea1P10711 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tcea1P10711 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tcea1P10711 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tcea1P10711 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tcea1P10711 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tcea1P10711 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tcea1P10711 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Tcea1P10711 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tcea1P10711 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tcea1P10711 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tcea1P10711 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tcea1P10711 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tcea1P10711 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tcea1P10711 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tcea1P10711 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tcea1P10711 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tcea1P10711 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tcea1P10711 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tcea1P10711 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Tcea1P10711 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tcea1P10711 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tcea1P10711 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tcea1P10711 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tcea1P10711 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tcea1P10711 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tcea1P10711 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tcea1P10711 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tcea1P10711 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tcea1P10711 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tcea1P10711 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tcea1P10711 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tcea1P10711 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tcea1P10711 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tcea1P10711 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tcea1P10711 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tcea1P10711 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tcea1P10711 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tcea1P10711 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tcea1P10711 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tcea1P10711 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Tcea1P10711 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tcea1P10711 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Tcea1P10711 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tcea1P10711 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tcea1P10711 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tcea1P10711 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tcea1P10711 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tcea1P10711 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tcea1P10711 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tcea1P10711 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tcea1P10711 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Tcea1P10711 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Tcea1P10711 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tcea1P10711 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tcea1P10711 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Tcea1P10711 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tcea1P10711 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tcea1P10711 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tcea1P10711 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tcea1P10711 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tcea1P10711 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Tcea1P10711 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tcea1P10711 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tcea1P10711 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tcea1P10711 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Tcea1P10711 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tcea1P10711 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tcea1P10711 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Tcea1P10711 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tcea1P10711 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tcea1P10711 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tcea1P10711 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tcea1P10711 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tcea1P10711 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tcea1P10711 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Tcea1P10711 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tcea1P10711 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tcea1P10711 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Tcea1P10711 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tcea1P10711 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tcea1P10711 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tcea1P10711 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tcea1P10711 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tcea1P10711 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tcea1P10711 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms