Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
P10404 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
P10404 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
P10404 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
P10404 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
P10404 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
P10404 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
P10404 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
P10404 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
P10404 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
P10404 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
P10404 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
P10404 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
P10404 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
P10404 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
P10404 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
P10404 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
P10404 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
P10404 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
P10404 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
P10404 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
P10404 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
P10404 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
P10404 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
P10404 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
P10404 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
P10404 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
P10404 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
P10404 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
P10404 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
P10404 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
P10404 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
P10404 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
P10404 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
P10404 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
P10404 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
P10404 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
P10404 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
P10404 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
P10404 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
P10404 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
P10404 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
P10404 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
P10404 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
P10404 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
P10404 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
P10404 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
P10404 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
P10404 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
P10404 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
P10404 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
P10404 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
P10404 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
P10404 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
P10404 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
P10404 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
P10404 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
P10404 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
P10404 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
P10404 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
P10404 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
P10404 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
P10404 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
P10404 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
P10404 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
P10404 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
P10404 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
P10404 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
P10404 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
P10404 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
P10404 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
P10404 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
P10404 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
P10404 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
P10404 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
P10404 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
P10404 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
P10404 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
P10404 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
P10404 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
P10404 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
P10404 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
P10404 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
P10404 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
P10404 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
P10404 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
P10404 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
P10404 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
P10404 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
P10404 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
P10404 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
P10404 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
P10404 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
P10404 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
P10404 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
P10404 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
P10404 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
P10404 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
P10404 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
P10404 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 196 ms