Protein–RNA interactions for Protein: P09174

Pde6g, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, mousemouse

Predictions only

Length 87 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6gP09174 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pde6gP09174 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pde6gP09174 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pde6gP09174 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pde6gP09174 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pde6gP09174 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pde6gP09174 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pde6gP09174 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pde6gP09174 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pde6gP09174 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pde6gP09174 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pde6gP09174 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pde6gP09174 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pde6gP09174 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pde6gP09174 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pde6gP09174 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pde6gP09174 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pde6gP09174 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pde6gP09174 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pde6gP09174 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pde6gP09174 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pde6gP09174 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pde6gP09174 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pde6gP09174 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pde6gP09174 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pde6gP09174 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pde6gP09174 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pde6gP09174 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pde6gP09174 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pde6gP09174 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pde6gP09174 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pde6gP09174 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pde6gP09174 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pde6gP09174 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pde6gP09174 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pde6gP09174 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pde6gP09174 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pde6gP09174 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pde6gP09174 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pde6gP09174 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pde6gP09174 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pde6gP09174 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pde6gP09174 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pde6gP09174 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde6gP09174 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde6gP09174 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde6gP09174 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pde6gP09174 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde6gP09174 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde6gP09174 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pde6gP09174 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pde6gP09174 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pde6gP09174 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pde6gP09174 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pde6gP09174 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pde6gP09174 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pde6gP09174 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pde6gP09174 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pde6gP09174 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pde6gP09174 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pde6gP09174 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pde6gP09174 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pde6gP09174 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pde6gP09174 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pde6gP09174 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pde6gP09174 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pde6gP09174 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pde6gP09174 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pde6gP09174 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pde6gP09174 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pde6gP09174 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pde6gP09174 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pde6gP09174 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pde6gP09174 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pde6gP09174 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pde6gP09174 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pde6gP09174 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pde6gP09174 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pde6gP09174 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pde6gP09174 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pde6gP09174 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pde6gP09174 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pde6gP09174 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pde6gP09174 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pde6gP09174 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pde6gP09174 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pde6gP09174 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pde6gP09174 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pde6gP09174 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pde6gP09174 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pde6gP09174 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pde6gP09174 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pde6gP09174 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pde6gP09174 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pde6gP09174 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pde6gP09174 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pde6gP09174 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pde6gP09174 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pde6gP09174 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pde6gP09174 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1325.4 ms